185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3395 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  100 
 
 
187 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  63.64 
 
 
192 aa  241  3.9999999999999997e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  74.63 
 
 
168 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  73.88 
 
 
168 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  77.59 
 
 
124 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  59.66 
 
 
154 aa  148  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  51.94 
 
 
188 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  43.38 
 
 
203 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  49.02 
 
 
185 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  41.86 
 
 
183 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  43.55 
 
 
187 aa  105  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  40.83 
 
 
184 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  41.32 
 
 
189 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  39.52 
 
 
201 aa  98.6  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  40 
 
 
203 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  39.32 
 
 
197 aa  92.8  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  38.4 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  38.4 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  38.4 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  39.5 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  40.95 
 
 
190 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  34.38 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.23 
 
 
161 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  39.56 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  33 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  33.33 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.73 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  33.63 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  33.67 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  33.06 
 
 
137 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.65 
 
 
155 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  31 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  33.67 
 
 
178 aa  62  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  37.97 
 
 
140 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  28.12 
 
 
173 aa  62  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  34.02 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  32.65 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  34.02 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  38.27 
 
 
200 aa  61.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  30.61 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  33.68 
 
 
139 aa  59.3  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  32.11 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  28.83 
 
 
174 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  28.07 
 
 
174 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  30.63 
 
 
135 aa  58.2  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  31.63 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  32.99 
 
 
172 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  33.63 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  28.57 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  34.15 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  29.09 
 
 
347 aa  57  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  28.69 
 
 
156 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  28.69 
 
 
156 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  29.79 
 
 
210 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  28.69 
 
 
162 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  26.23 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  28.69 
 
 
156 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  33.33 
 
 
145 aa  55.1  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  30.48 
 
 
136 aa  54.7  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  34.15 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  31.63 
 
 
132 aa  54.7  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  35.8 
 
 
192 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  26.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  26.61 
 
 
185 aa  54.3  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  30.59 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  32.95 
 
 
167 aa  52.4  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  27.93 
 
 
1005 aa  52.4  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.17 
 
 
382 aa  52.4  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  41.54 
 
 
140 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  30.43 
 
 
1585 aa  52  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  33.82 
 
 
542 aa  51.6  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
128 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  27.52 
 
 
331 aa  51.6  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  31.78 
 
 
640 aa  51.6  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  32.48 
 
 
162 aa  51.2  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  24.56 
 
 
171 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  32.14 
 
 
291 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  23.81 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  31.58 
 
 
646 aa  50.8  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  28.71 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  29.36 
 
 
274 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  27.83 
 
 
426 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  33.33 
 
 
173 aa  49.7  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  32.26 
 
 
135 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  29.67 
 
 
208 aa  49.3  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  30.84 
 
 
1133 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  32.76 
 
 
4520 aa  49.3  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  27.88 
 
 
494 aa  48.9  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  30.97 
 
 
790 aa  48.5  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  42.86 
 
 
222 aa  48.5  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.63 
 
 
404 aa  48.5  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
1030 aa  48.5  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  34.48 
 
 
269 aa  48.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  31 
 
 
337 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  29.14 
 
 
191 aa  48.1  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1493  Ankyrin  32.69 
 
 
123 aa  48.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.643551  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  32 
 
 
321 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  28.97 
 
 
157 aa  47  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  26.36 
 
 
122 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  30.61 
 
 
581 aa  46.6  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>