More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0488 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  100 
 
 
176 aa  346  9e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  79.43 
 
 
240 aa  269  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  54.19 
 
 
285 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  54.82 
 
 
217 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2345  Ankyrin  57.14 
 
 
233 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  55.84 
 
 
214 aa  168  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  58.94 
 
 
237 aa  166  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  54.19 
 
 
227 aa  159  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32350  hypothetical protein  56.58 
 
 
210 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.234736  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2741  hypothetical protein  55.92 
 
 
210 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0456  ankyrin repeat domain protein  50 
 
 
196 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0121916 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  49.35 
 
 
226 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  50 
 
 
226 aa  152  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4788  ankyrin repeat domain protein  50 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4402  ankyrin repeat-containing protein  49.35 
 
 
196 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  49.35 
 
 
196 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4922  ankyrin repeat-containing protein  50 
 
 
196 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.573974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  50.3 
 
 
224 aa  148  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3296  ankyrin  50.65 
 
 
254 aa  147  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.172473 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  44.17 
 
 
234 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4030  Ankyrin  47.4 
 
 
221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.147969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  43.87 
 
 
254 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  43.79 
 
 
266 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  47.89 
 
 
269 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2944  Ankyrin  49.04 
 
 
455 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000965114  hitchhiker  0.000150553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0925  conserved hypothetical protein; ankyrin repeateat; putative exported protein  41.94 
 
 
224 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144678  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3814  Ankyrin  40.96 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523851 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0781  aankyrin repeat-containing protein  45.1 
 
 
261 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.150495  normal  0.0323069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0798  aankyrin repeat-containing protein  43.79 
 
 
264 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234452  normal  0.451941 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0349  ankyrin repeat-containing protein  41.78 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0728  Ankyrin  43.79 
 
 
264 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.365587  normal  0.800826 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3145  ankyrin  39.74 
 
 
201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000605686  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  39.1 
 
 
289 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  39.1 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  39.1 
 
 
207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  39.1 
 
 
255 aa  112  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  38.71 
 
 
290 aa  111  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  39.1 
 
 
255 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  38.06 
 
 
290 aa  110  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0382  ankyrin repeat protein  41.1 
 
 
201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.415795 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  38.46 
 
 
249 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  38.06 
 
 
277 aa  108  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0379  ankyrin repeat-containing protein  40.41 
 
 
201 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.89591  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3305  ankyrin  40.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00274  predicted transcriptional regulator with ankyrin domain  40.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.528097  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3288  Ankyrin  40.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0337  ankyrin repeat-containing protein  40.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00277  hypothetical protein  40.41 
 
 
201 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.568599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  37.42 
 
 
289 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0149  ankyrin  43.38 
 
 
237 aa  101  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4103  ankyrin  39.57 
 
 
238 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2793  Ankyrin  46.39 
 
 
232 aa  85.9  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176695  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  37.96 
 
 
2171 aa  84.3  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2632  Ankyrin  33.77 
 
 
210 aa  84  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000031209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  33.56 
 
 
382 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32 
 
 
1585 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.14 
 
 
404 aa  72.8  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.55 
 
 
494 aa  72  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  37.3 
 
 
1156 aa  71.6  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.23 
 
 
426 aa  71.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  32.47 
 
 
305 aa  71.2  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  35.29 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  33.33 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1881  peptidase M56, BlaR1  35.98 
 
 
556 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.553745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.61 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0988  ankyrin  26.71 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0503606 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  32.62 
 
 
790 aa  67.8  0.00000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  31.85 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  30.32 
 
 
216 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  37.21 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  39.13 
 
 
395 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  33.33 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  27.45 
 
 
715 aa  65.1  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.42 
 
 
321 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  34.62 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  34.07 
 
 
347 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  31.48 
 
 
161 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  35.71 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.55 
 
 
490 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
469 aa  63.2  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  31.14 
 
 
287 aa  63.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  35.51 
 
 
218 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  29.59 
 
 
731 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  33.33 
 
 
157 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2208  Ankyrin  33.33 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00294118  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  30.12 
 
 
274 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  34.87 
 
 
174 aa  61.6  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  27.84 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  28.83 
 
 
172 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  32.68 
 
 
219 aa  61.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  35.1 
 
 
293 aa  60.8  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  31.37 
 
 
184 aa  60.5  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  28.41 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3653  ankyrin repeat-containing protein  34.75 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  31.17 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  30.52 
 
 
217 aa  60.5  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  32.39 
 
 
541 aa  59.7  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  26.71 
 
 
345 aa  60.1  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  33.54 
 
 
194 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>