284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
135 aa  273  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  64.75 
 
 
137 aa  164  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  64.46 
 
 
130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  63.93 
 
 
125 aa  154  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  56.49 
 
 
136 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  54.29 
 
 
178 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  53.57 
 
 
178 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  54.41 
 
 
175 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  50 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  57.63 
 
 
167 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  48.51 
 
 
132 aa  122  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  53.28 
 
 
145 aa  115  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  51.91 
 
 
140 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  50 
 
 
171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  49.25 
 
 
172 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  49.25 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  54.21 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  52.21 
 
 
128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  49.6 
 
 
200 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  46.61 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  49.6 
 
 
192 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  43.94 
 
 
173 aa  107  6e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  47.41 
 
 
181 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  48 
 
 
194 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  46.9 
 
 
128 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  48 
 
 
174 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  51.49 
 
 
176 aa  103  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  47.2 
 
 
195 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  47.1 
 
 
181 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  51.55 
 
 
187 aa  98.2  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  51.55 
 
 
187 aa  98.2  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  46.96 
 
 
122 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  46.72 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  39.69 
 
 
172 aa  94.7  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  45.9 
 
 
174 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  45.9 
 
 
174 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  45.9 
 
 
174 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  37.78 
 
 
162 aa  87.8  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  34.81 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  36.03 
 
 
156 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  36.03 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  36.07 
 
 
197 aa  76.3  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  36.21 
 
 
185 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  35.59 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  34.07 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  36.52 
 
 
183 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  33.06 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  34.78 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  38.18 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  34.35 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.23 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  32.2 
 
 
189 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  39.06 
 
 
190 aa  63.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  41.84 
 
 
870 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  34.78 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  33.93 
 
 
203 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  39.77 
 
 
194 aa  60.8  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  37.5 
 
 
344 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  34.75 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  38.26 
 
 
176 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  30.63 
 
 
187 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4567  ankyrin repeat-containing protein  29.91 
 
 
226 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.928226  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  31.47 
 
 
483 aa  57.8  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  33.33 
 
 
192 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.94 
 
 
490 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  37.37 
 
 
208 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2117  rhodanese-like domain/ankyrin repeat-containing protein  33.63 
 
 
254 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  28.68 
 
 
188 aa  57  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  31.88 
 
 
168 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  31.43 
 
 
541 aa  57  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  33.93 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  39.02 
 
 
203 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0493  ankyrin  33.33 
 
 
254 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  31.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  31.16 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.52 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  31.3 
 
 
185 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  35.96 
 
 
203 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  38.46 
 
 
347 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4783  ankyrin repeat domain protein  28.97 
 
 
226 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  36.56 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  31.25 
 
 
124 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  38.27 
 
 
395 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2658  PDZ/DHR/GLGF:ankyrin  46.43 
 
 
1003 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  29.17 
 
 
163 aa  53.5  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  34.95 
 
 
442 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  33.91 
 
 
321 aa  53.5  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0999  Ankyrin  30.43 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.78694  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  31.06 
 
 
1585 aa  52.8  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  37.21 
 
 
442 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  36.36 
 
 
269 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1663  FOG: Ankyrin repeat protein  33.33 
 
 
285 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.10004 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  30.58 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0645  Ankyrin  33.91 
 
 
240 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4419  ankyrin repeat-containing protein  34.15 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  32.14 
 
 
219 aa  52  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2348  ankyrin  27.78 
 
 
149 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.614743  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>