183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00470 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
122 aa  242  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  52.59 
 
 
132 aa  111  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  51.35 
 
 
139 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  54.05 
 
 
136 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  50.94 
 
 
130 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  46.96 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  45.95 
 
 
137 aa  94.4  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  52.75 
 
 
172 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  54.55 
 
 
174 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  47.75 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  53.41 
 
 
174 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  44.92 
 
 
171 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  43.59 
 
 
181 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  44.8 
 
 
181 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  44.83 
 
 
175 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  44.07 
 
 
171 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  51.69 
 
 
187 aa  85.5  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  44.17 
 
 
174 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  51.69 
 
 
187 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  45.95 
 
 
145 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  42.74 
 
 
178 aa  84.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  51.14 
 
 
174 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  42.74 
 
 
178 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  52.73 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  46.49 
 
 
174 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  44.86 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  41.23 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  41.23 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  49.57 
 
 
176 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  43.93 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  40.35 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  45.63 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  39.32 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  47.75 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  43.18 
 
 
173 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  41.38 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  37.84 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  39.47 
 
 
192 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  36.78 
 
 
172 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  35.65 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  35.65 
 
 
183 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  35.65 
 
 
185 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  34.48 
 
 
161 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  31.93 
 
 
197 aa  60.8  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  31.4 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  35.63 
 
 
156 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  35.63 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  32.17 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  37.61 
 
 
222 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  36.04 
 
 
243 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  37.5 
 
 
329 aa  54.3  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1214  ankyrin  36.36 
 
 
1101 aa  54.3  0.0000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1244  ankyrin-like protein  35.45 
 
 
1099 aa  53.9  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  39.02 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  39.02 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  39.02 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0072  Ankyrin  34.12 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02885  ankyrin-like protein  35.14 
 
 
1097 aa  52.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  33.33 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  30.17 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  33.33 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.97 
 
 
382 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  35.23 
 
 
203 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  31.09 
 
 
155 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  30.25 
 
 
855 aa  51.6  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  28.45 
 
 
184 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  36.47 
 
 
203 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  32.22 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3905  Ankyrin  35.14 
 
 
1112 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  32.22 
 
 
185 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  32.22 
 
 
278 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  33.33 
 
 
188 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  36.36 
 
 
194 aa  50.1  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  28.45 
 
 
189 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.74 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  33.06 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2852  ankyrin  37.38 
 
 
205 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0488  ankyrin  36.19 
 
 
176 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  29.82 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_9151  predicted protein  33.33 
 
 
120 aa  47.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00609094  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  26.36 
 
 
187 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  33.04 
 
 
135 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.01 
 
 
450 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09187  conserved hypothetical protein  38.55 
 
 
747 aa  47  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.511883 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  37.27 
 
 
287 aa  47  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  31.36 
 
 
155 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  29.91 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  33.01 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.01 
 
 
490 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  34.44 
 
 
219 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  36.97 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2821  ankyrin  32.43 
 
 
208 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182298  normal  0.0986627 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  36.9 
 
 
307 aa  45.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  37.37 
 
 
346 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  38.46 
 
 
494 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  29.41 
 
 
891 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0428  Ankyrin  35.71 
 
 
222 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  28.74 
 
 
192 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  35.37 
 
 
1061 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  33 
 
 
217 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>