More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1442 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  100 
 
 
174 aa  342  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  91.38 
 
 
174 aa  311  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  90.23 
 
 
174 aa  308  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  87.36 
 
 
174 aa  298  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  68.71 
 
 
181 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  65.5 
 
 
181 aa  222  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  62.64 
 
 
172 aa  214  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  59.64 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  58.39 
 
 
178 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  58.18 
 
 
194 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  57.99 
 
 
200 aa  176  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  57.14 
 
 
178 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  58.18 
 
 
195 aa  174  5e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  58.08 
 
 
176 aa  168  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  52.73 
 
 
175 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  56.1 
 
 
171 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  56.71 
 
 
171 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  54.71 
 
 
192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  53.42 
 
 
173 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  56.64 
 
 
187 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  56.64 
 
 
187 aa  155  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  52.6 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  42.86 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  48.44 
 
 
125 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  47.86 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  51.24 
 
 
139 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  50.4 
 
 
145 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  42.22 
 
 
201 aa  105  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  46.4 
 
 
130 aa  103  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  39.6 
 
 
185 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  39.17 
 
 
156 aa  95.1  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  41.23 
 
 
162 aa  95.1  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  39.17 
 
 
156 aa  94.4  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  39.17 
 
 
156 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  40.31 
 
 
187 aa  94  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  45.9 
 
 
135 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  34.72 
 
 
197 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  36.43 
 
 
184 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.23 
 
 
157 aa  89.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  40.46 
 
 
183 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  40.77 
 
 
128 aa  89.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  35.66 
 
 
189 aa  89  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  34.9 
 
 
173 aa  87.4  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  53.85 
 
 
140 aa  87.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  45.83 
 
 
137 aa  87  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  37.21 
 
 
197 aa  86.7  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  37.23 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  40.31 
 
 
203 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  38.62 
 
 
216 aa  85.9  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  37.23 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  37.23 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  36.09 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  43.7 
 
 
149 aa  84.7  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  51.14 
 
 
122 aa  84.3  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  44.44 
 
 
128 aa  84.3  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  43.75 
 
 
136 aa  83.6  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  33.8 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32.92 
 
 
217 aa  82  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  37.21 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  37.78 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  36.99 
 
 
138 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.85 
 
 
2171 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  35.38 
 
 
427 aa  78.6  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.8 
 
 
382 aa  77.8  0.00000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  39.5 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  32.88 
 
 
855 aa  76.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  37.7 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  34.81 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  37.98 
 
 
219 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  39.85 
 
 
490 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  31.82 
 
 
297 aa  76.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  35.42 
 
 
321 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  30.77 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  30.77 
 
 
185 aa  74.7  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  33.54 
 
 
222 aa  74.7  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  43.16 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.51 
 
 
1402 aa  74.7  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  36.43 
 
 
163 aa  73.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.57 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  40 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  37.17 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  39.53 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.81 
 
 
1061 aa  72.8  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  35.38 
 
 
247 aa  72  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  39.06 
 
 
222 aa  72  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  35.25 
 
 
186 aa  72  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.59 
 
 
1585 aa  72  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  33.33 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  34.03 
 
 
711 aa  71.6  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  33.1 
 
 
347 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.68 
 
 
1030 aa  70.9  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.88 
 
 
870 aa  70.9  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32.62 
 
 
344 aa  70.9  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  36.45 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  32.48 
 
 
762 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  30.07 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  37.72 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  33.56 
 
 
1133 aa  69.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.88 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  30.07 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>