More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0274 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  100 
 
 		 162 aa  332  1e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  74.34 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  73.68 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  73.03 
 
 		 156 aa  234  3e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  56.33 
 
 		 172 aa  187  5.999999999999999e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  42.64 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  41.04 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  42.86 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  43.38 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  43.38 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  42.4 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  43.2 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  42.11 
 
 		 171 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  42.4 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  44.74 
 
 		 174 aa  103  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  44.74 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  40.32 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  42.19 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  42.98 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  41.53 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  42.5 
 
 		 172 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  37.9 
 
 		 161 aa  96.3  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  41.53 
 
 		 200 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  41.23 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  42.98 
 
 		 195 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  42.98 
 
 		 194 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  43.97 
 
 		 139 aa  94.4  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  39.52 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  37.78 
 
 		 135 aa  87.8  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  31.54 
 
 		 174 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.94 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  36.36 
 
 		 163 aa  85.5  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  43.82 
 
 		 145 aa  84  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  43.18 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  34.85 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  37.1 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  32.64 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  34.29 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  33.59 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  39.8 
 
 		 137 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  32.52 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  38.83 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  37.59 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  36.44 
 
 		 128 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  35.82 
 
 		 1249 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  34.96 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  33.9 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  40.35 
 
 		 176 aa  74.3  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  31.15 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  33.05 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00470  ankyrin repeat-containing protein  41.38 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.776802 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11740  ankyrin repeat-containing protein  40.96 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.261749  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  33.6 
 
 		 190 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 1030 aa  70.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  29.41 
 
 		 426 aa  70.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  31.09 
 
 		 954 aa  70.5  0.000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  40.91 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2171 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  32.2 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.33 
 
 		 490 aa  68.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1958  Ankyrin  31.4 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  32.46 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  32.46 
 
 		 185 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4179  Ankyrin  34.19 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0287767  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  31.75 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  29.46 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  28.15 
 
 		 750 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  36.84 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1585 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.96 
 
 		 870 aa  65.1  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.32 
 
 		 404 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  32.23 
 
 		 217 aa  63.9  0.0000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  30.16 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  33.64 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  29.36 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  31.3 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1402 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  32.04 
 
 		 2413 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  30.56 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  25.62 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  30.65 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  28.36 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  30.48 
 
 		 511 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  31.82 
 
 		 855 aa  60.8  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  33.93 
 
 		 278 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  29.52 
 
 		 395 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  31.11 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.63 
 
 		 1061 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  33.93 
 
 		 483 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  28.8 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  27.03 
 
 		 289 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.43 
 
 		 762 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0533  ankyrin repeat-containing protein  27.03 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0564  ankyrin repeat-containing protein  27.03 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  32.08 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  27.93 
 
 		 347 aa  58.5  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30 
 
 		 545 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  29.73 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0361  ankyrin  28.69 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0332017 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2852  ankyrin  28.23 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>