More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3354 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3354  ankyrin  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0944137  normal  0.0422301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3583  ankyrin domain protein  86.24 
 
 		 184 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381632  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02831  ankyrin AnkB  67.31 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3136  ankyrin  65.75 
 
 		 201 aa  203  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.311886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5252  hypothetical protein  52.46 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.626004  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0972  Ankyrin  50.79 
 
 		 197 aa  193  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61020  hypothetical protein  57.79 
 
 		 183 aa  191  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2031  ankyrin  51.37 
 
 		 203 aa  184  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1108  ankyrin  46.67 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0116329  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  43.45 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06579  hypothetical protein  45.38 
 
 		 154 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1187  ankyrin repeat-containing protein  40.61 
 
 		 188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0251  ankyrin  38.32 
 
 		 168 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0254  ankyrin  37.72 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0126  ankyrin  42.86 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2346  Ankyrin  37.75 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2195  ankyrin repeat-containing protein  38.04 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00731252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0378  ankyrin  45.39 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00324909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3395  ankyrin  36.77 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.837562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4469  ankyrin  40.44 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607669  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3897  ankyrin  40.44 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.497005 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3630  ankyrin  40.44 
 
 		 203 aa  101  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3252  AnkB protein  41.74 
 
 		 124 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0103832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3262  Ankyrin  41.67 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00689099  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2051  ankyrin domain protein  38.36 
 
 		 181 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0348951  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  38.69 
 
 		 161 aa  98.2  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3876  ankyrin  34.67 
 
 		 174 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0424681  normal  0.353602 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  36.96 
 
 		 172 aa  94.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  35.42 
 
 		 181 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  40.31 
 
 		 175 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  40.77 
 
 		 157 aa  92.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1442  ankyrin  34.25 
 
 		 174 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.858603  normal  0.0446187 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4673  Ankyrin  44.19 
 
 		 162 aa  90.5  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.367639  hitchhiker  0.00000788289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1834  ankyrin domain-containing protein  34.25 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.268175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5275  Ankyrin  36.57 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.667111 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1343  ankyrin domain-containing protein  34.59 
 
 		 178 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0374452 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  35.86 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  32.88 
 
 		 174 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  36.11 
 
 		 170 aa  85.9  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  38.17 
 
 		 155 aa  85.1  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1831  hypothetical protein  37.21 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2449  Ankyrin  40.83 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21530  ankyrin domain-containing protein  33.77 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.190597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  35.57 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0807  ankyrin  34.31 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.393764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3164  ankyrin  35.07 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139563  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  34.42 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2707  Ankyrin  43.75 
 
 		 128 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.217591  normal  0.216365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  34.19 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  33.83 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  33.83 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1005 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07000  Ankyrin-like protein  35.61 
 
 		 173 aa  77.8  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2325  ankyrin  38.84 
 
 		 125 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3007  ankyrin  38.57 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.81586  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  37.4 
 
 		 2171 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2090  Ankyrin  35.77 
 
 		 176 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  36.51 
 
 		 382 aa  74.7  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  26.04 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1585 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21100  ankyrin repeat-containing protein  39.84 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697064  normal  0.168349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6867  hypothetical protein  38.66 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.883944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  33.57 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  34.59 
 
 		 715 aa  72  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  38.14 
 
 		 583 aa  70.9  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  33.33 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  29.17 
 
 		 450 aa  68.6  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  38.14 
 
 		 584 aa  68.2  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.11 
 
 		 1402 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  29.7 
 
 		 331 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  34.92 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4245  Ankyrin  38.24 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0179  Ankyrin  40.74 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241008  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  31.68 
 
 		 870 aa  65.9  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  29.37 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  32.84 
 
 		 4520 aa  65.5  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0264  ankyrin repeat-containing protein  30.6 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.03 
 
 		 404 aa  65.1  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2134  Ankyrin  37.84 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1577  ankyrin repeat-containing protein  30.6 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.651812  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1388  ankyrin repeat-containing protein  30.6 
 
 		 156 aa  64.7  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000015487  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06230  ankyrin repeat protein  36.61 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22650  ankyrin repeat-containing protein  32.2 
 
 		 135 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  32 
 
 		 954 aa  64.3  0.000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2718  Ankyrin  35.65 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000951266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1535  ankyrin  37.4 
 
 		 137 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.180065  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  32.82 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1250  ankyrin  33.05 
 
 		 144 aa  63.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  33.56 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  32.06 
 
 		 1156 aa  63.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.75 
 
 		 762 aa  63.2  0.000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  36.52 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0274  conserved hypothetical protein, ankyrin repeat family protein  30.16 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1056  ankyrin repeat-containing protein  32.35 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.82457  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  33.08 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2058  hypothetical protein  33.08 
 
 		 580 aa  62.4  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  28.39 
 
 		 278 aa  62  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  31.58 
 
 		 305 aa  61.6  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 		 1030 aa  61.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  33.82 
 
 		 811 aa  61.6  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>