More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1421 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  94.01 
 
 
284 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  82.07 
 
 
291 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  67.72 
 
 
226 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  58.23 
 
 
248 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  47.83 
 
 
257 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  50.77 
 
 
241 aa  192  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  49.49 
 
 
250 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  47.89 
 
 
240 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  47.89 
 
 
242 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  47.89 
 
 
242 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  50.55 
 
 
235 aa  175  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  48.79 
 
 
240 aa  175  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  48.31 
 
 
235 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  48.31 
 
 
235 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  48.31 
 
 
235 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  48.31 
 
 
235 aa  175  9e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  43.48 
 
 
236 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  43.48 
 
 
236 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  43.48 
 
 
236 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  46.5 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  46.5 
 
 
236 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  44 
 
 
236 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  41.83 
 
 
223 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  35.15 
 
 
236 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  43.28 
 
 
228 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  41.06 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  44.5 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  42.7 
 
 
223 aa  131  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  38.14 
 
 
247 aa  122  7e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  39.8 
 
 
218 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  42.2 
 
 
222 aa  118  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  39.63 
 
 
231 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  35.58 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36.79 
 
 
219 aa  101  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  36.22 
 
 
208 aa  99  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32.77 
 
 
344 aa  98.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  37.13 
 
 
1585 aa  97.4  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  32.12 
 
 
870 aa  85.1  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  32.42 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  31.03 
 
 
243 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.11 
 
 
954 aa  80.5  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  29.74 
 
 
321 aa  79  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  31.47 
 
 
2413 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  30.85 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  34.18 
 
 
469 aa  76.3  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  31.45 
 
 
762 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  36.65 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  30.99 
 
 
1156 aa  72  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  32.5 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  30.27 
 
 
1061 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  39.85 
 
 
711 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0458  Ankyrin  32.19 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510961  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1581  hypothetical protein  34.06 
 
 
157 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_5133  predicted protein  38.89 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.648247  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  33.77 
 
 
1402 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2092  Ankyrin  32.05 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  32.08 
 
 
382 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2379  Ankyrin  32.05 
 
 
185 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000440604 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  27.88 
 
 
891 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  37.89 
 
 
1030 aa  66.2  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  34.27 
 
 
494 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.57 
 
 
483 aa  65.1  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  31.71 
 
 
426 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  32.06 
 
 
166 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  30.86 
 
 
329 aa  63.9  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  36.59 
 
 
194 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  31.15 
 
 
135 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  33.13 
 
 
427 aa  64.7  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  35.71 
 
 
175 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 
1021 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0475  ankyrin repeat-containing protein  30.64 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.498558  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0620  ankyrin repeat domain protein  30.64 
 
 
289 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  29.27 
 
 
723 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  30.34 
 
 
821 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3421  Ankyrin  30.97 
 
 
197 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.175263  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0477  ankyrin repeat-containing protein  30.64 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  43.48 
 
 
140 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1063  Ankyrin  35.79 
 
 
341 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  34.19 
 
 
490 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  28.41 
 
 
2171 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  31.55 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2896  ankyrin-related protein  33.12 
 
 
346 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  31.18 
 
 
541 aa  62.8  0.000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0477  ankyrin repeat-containing protein  27.91 
 
 
290 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0694  ankyrin repeat domain protein  30.06 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02373  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 
785 aa  62.4  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4432  Ankyrin  35.77 
 
 
195 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4739  ankyrin repeat domain protein  28.48 
 
 
289 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  28.31 
 
 
790 aa  62  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0996  hypothetical protein  26.27 
 
 
447 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0836466 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0626  ankyrin repeat-containing protein  30.06 
 
 
255 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  30.99 
 
 
369 aa  61.6  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  31.64 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  41.05 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  27.45 
 
 
293 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  32.09 
 
 
750 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  41.05 
 
 
187 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0600  ankyrin repeat domain protein  27.88 
 
 
277 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  36.84 
 
 
151 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>