More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2259 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  100 
 
 
218 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  60.47 
 
 
223 aa  271  8.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  56.28 
 
 
223 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  54.31 
 
 
225 aa  226  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  54.41 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1983  Ankyrin  51.92 
 
 
228 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1721  ankyrin  52.94 
 
 
228 aa  207  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0643152 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  50.74 
 
 
231 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  43.5 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  44.62 
 
 
236 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  44.33 
 
 
235 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  42.21 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  43.5 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  43.5 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  43.5 
 
 
236 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  43.08 
 
 
236 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  41.29 
 
 
250 aa  160  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  43.08 
 
 
236 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1856  hypothetical protein  43.3 
 
 
208 aa  160  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  44.68 
 
 
240 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  44.68 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  44.68 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  44.57 
 
 
235 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  44.57 
 
 
235 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  44.57 
 
 
235 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  44.57 
 
 
235 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  44.57 
 
 
240 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  42.56 
 
 
257 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1438  ankyrin  43.2 
 
 
248 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1824  ankyrin  44.44 
 
 
226 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0109877  hitchhiker  0.0044061 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0963  ankyrin  39.9 
 
 
236 aa  136  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  37.95 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1788  aankyrin repeat-containing protein  39.9 
 
 
291 aa  129  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1462  Ankyrin  40.31 
 
 
284 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.640489  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1421  Ankyrin  39.8 
 
 
284 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2193  ankyrin  36 
 
 
219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.862508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3110  ankyrin  32.83 
 
 
344 aa  97.4  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2499  Ankyrin  35.14 
 
 
243 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0280385  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  33.91 
 
 
1585 aa  88.2  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  36.77 
 
 
762 aa  86.3  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  34.59 
 
 
140 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  38.35 
 
 
469 aa  84  0.000000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  36.18 
 
 
1402 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  33.83 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  34.03 
 
 
870 aa  82.8  0.000000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  38.97 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  32.99 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  37.82 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.95 
 
 
541 aa  80.1  0.00000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  33.11 
 
 
426 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  30.32 
 
 
382 aa  79.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  33.58 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  31.82 
 
 
321 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.57 
 
 
2413 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  37.59 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  28.57 
 
 
4520 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2256  ankyrin  45.45 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.410202  normal  0.75483 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.76 
 
 
891 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  35.71 
 
 
483 aa  77  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1618  Ankyrin  45.45 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48690  Rhodanese-like protein with Ankyrin repeat  38.41 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  34.94 
 
 
287 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  39.83 
 
 
1005 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  32.84 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  35.29 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  32.14 
 
 
646 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  35.95 
 
 
855 aa  75.9  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  29.89 
 
 
345 aa  75.9  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  35.53 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  35 
 
 
1156 aa  75.5  0.0000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  31.98 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  29.69 
 
 
640 aa  75.1  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2413  ankyrin repeat-containing protein  30.05 
 
 
220 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.243024  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  32.65 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3569  ankyrin  29.8 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419939 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  32.58 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  30.94 
 
 
490 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  30.3 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  36.84 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3561  Ankyrin  30.48 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2061  hypothetical protein  32.02 
 
 
584 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  41.44 
 
 
583 aa  72.8  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  30.32 
 
 
2122 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  30.11 
 
 
1030 aa  72.4  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  34.12 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  35.48 
 
 
2171 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  34.5 
 
 
395 aa  72.4  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4177  ankyrin  40.71 
 
 
175 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  28.99 
 
 
954 aa  71.6  0.000000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  32.93 
 
 
1061 aa  71.6  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  31.45 
 
 
740 aa  71.6  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  35.92 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1450  Ankyrin  24.17 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  31.17 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  31.76 
 
 
472 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  31.94 
 
 
731 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  31.84 
 
 
358 aa  70.9  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4065  ankyrin  39.82 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.361262  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4546  Ankyrin  39.82 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  35 
 
 
723 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>