More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3435 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  100 
 
 
141 aa  283  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  85.82 
 
 
141 aa  238  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  70.07 
 
 
142 aa  200  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  59.29 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  57.86 
 
 
140 aa  158  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  58.02 
 
 
149 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  57.25 
 
 
149 aa  150  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  38.52 
 
 
469 aa  89.4  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1952  ankyrin  41.04 
 
 
223 aa  89.4  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2666  ankyrin  43.55 
 
 
237 aa  85.5  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.931958  hitchhiker  0.000000569803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  36.92 
 
 
891 aa  85.9  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  40.32 
 
 
423 aa  84  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  36.15 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  38.06 
 
 
1030 aa  82.8  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1799  ankyrin  40.31 
 
 
236 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912311 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2259  ankyrin  36.84 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1827  ankyrin  40.31 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0395685  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1384  ankyrin  40.31 
 
 
235 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  34.11 
 
 
382 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  39.84 
 
 
541 aa  80.9  0.000000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5190  ankyrin repeat-containing protein  40.31 
 
 
236 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.210108 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1890  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0277934  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.22 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1913  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0270531 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6189  ankyrin repeat-containing protein  38.76 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385081  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2515  ankyrin  42.24 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0959438  normal  0.0106396 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  38.17 
 
 
494 aa  78.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2854  ankyrin  40.32 
 
 
225 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  38.69 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  42.98 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  38.58 
 
 
762 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2259  ankyrin repeat-containing signal peptide protein  38.4 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980373  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  43.86 
 
 
870 aa  75.5  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1943  Ankyrin  38.4 
 
 
241 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.579391 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  39.83 
 
 
756 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  37.01 
 
 
954 aa  74.3  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  37.69 
 
 
321 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_002978  WD0498  ankyrin repeat-containing protein  35.92 
 
 
335 aa  73.9  0.0000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  34.68 
 
 
1585 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  38.58 
 
 
305 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3006  ankyrin  35.71 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1185  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1421  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.89673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1912  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2158  ankyrin repeat-containing protein  37.6 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3392  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  35.38 
 
 
2413 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  38.84 
 
 
1156 aa  72.4  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2277  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1009  ankyrin  37.23 
 
 
222 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2316  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.482363  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0104  ankyrin  39.5 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2438  ankyrin repeat-containing protein  36.72 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  34.81 
 
 
337 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  37.5 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1046  ankyrin  36.23 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.398559  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5572  Ankyrin  37.29 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.43275  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02010  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  37.01 
 
 
236 aa  71.6  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  33.85 
 
 
347 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1844  ankyrin  42.28 
 
 
619 aa  70.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  39.06 
 
 
426 aa  71.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  38.17 
 
 
2171 aa  70.9  0.000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2388  ankyrin  37.29 
 
 
217 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.751385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2451  Ankyrin  35.34 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  39.32 
 
 
395 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1860  ankyrin  36.84 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.43131 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5420  ankyrin  42.24 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  39.17 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  35.88 
 
 
865 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  37.82 
 
 
490 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6564  Ankyrin  37.98 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3408  ankyrin  35.71 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.90032  normal  0.939091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4648  ankyrin  36.76 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.90503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0662  ankyrin  37.21 
 
 
358 aa  67.8  0.00000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00179604  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  38.33 
 
 
811 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1640  hypothetical protein  33.33 
 
 
297 aa  67.8  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.951385  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1071  ankyrin  38.14 
 
 
342 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  38.21 
 
 
1402 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3533  Ankyrin  38.97 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.254367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  39.53 
 
 
483 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  37.5 
 
 
723 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  31.06 
 
 
542 aa  67.4  0.00000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1865  hypothetical protein  32.28 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000370925 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5600  hypothetical protein  40.52 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10397  conserved hypothetical protein  39.68 
 
 
307 aa  67  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2488  Ankyrin  38.89 
 
 
196 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  36.52 
 
 
640 aa  67  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  34.85 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5249  ankyrin  43.1 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  32.5 
 
 
646 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  36.3 
 
 
474 aa  66.2  0.0000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  40.95 
 
 
404 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  37.21 
 
 
135 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  34.17 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  34.65 
 
 
855 aa  65.5  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1412  ankyrin  38.33 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  36.8 
 
 
545 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  43.3 
 
 
368 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3392  ankyrin  33.81 
 
 
247 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097583 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1461  ankyrin repeat-containing protein  34.88 
 
 
258 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>