57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1403 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  81.37 
 
 
510 aa  840    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  100 
 
 
509 aa  1030    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  85.27 
 
 
509 aa  884    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  31.13 
 
 
903 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.66 
 
 
900 aa  81.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 
261 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.74 
 
 
324 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
871 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  27.52 
 
 
898 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  29.69 
 
 
446 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  30.32 
 
 
432 aa  64.3  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  30.41 
 
 
446 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  25.54 
 
 
890 aa  61.6  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.53 
 
 
428 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  24.8 
 
 
1619 aa  60.1  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 
464 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.13 
 
 
1196 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.69 
 
 
309 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.37 
 
 
477 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.89 
 
 
561 aa  55.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.9 
 
 
1343 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  24.26 
 
 
442 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 
615 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.17 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 
615 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.92 
 
 
925 aa  53.5  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1873  hypothetical protein  30.23 
 
 
603 aa  53.5  0.000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.505982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 
301 aa  52.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.88 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.84 
 
 
324 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.36 
 
 
265 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.62 
 
 
538 aa  48.9  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  26.85 
 
 
293 aa  49.3  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
579 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.49 
 
 
322 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6471  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.98 
 
 
1274 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.707662  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0119  hypothetical protein  22.99 
 
 
901 aa  47.8  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 
324 aa  47.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
578 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
538 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0090  hypothetical protein  23.83 
 
 
860 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000863747 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 
531 aa  47.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24 
 
 
578 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.56 
 
 
795 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.56 
 
 
795 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.73 
 
 
491 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  32.39 
 
 
1390 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.31 
 
 
355 aa  45.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.12 
 
 
499 aa  45.1  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
629 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.45 
 
 
633 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.27 
 
 
445 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.49 
 
 
305 aa  43.9  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.18 
 
 
590 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  25.81 
 
 
276 aa  43.9  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
1106 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.55 
 
 
489 aa  43.5  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>