86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0867 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
491 aa  999    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6053  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.39 
 
 
843 aa  160  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7211  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.41 
 
 
841 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0794016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.74 
 
 
654 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.99 
 
 
270 aa  87.8  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  38.06 
 
 
293 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.01 
 
 
278 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.6 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1193  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.55 
 
 
275 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.95 
 
 
276 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.6 
 
 
615 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.36 
 
 
633 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.39 
 
 
275 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.97 
 
 
907 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  34.62 
 
 
378 aa  71.6  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.57 
 
 
979 aa  69.7  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00130  caspase, putative  35.37 
 
 
517 aa  69.7  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0136994  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  30.59 
 
 
292 aa  68.9  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1229  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.01 
 
 
302 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2085  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.1 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.11018  normal  0.0186751 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 
898 aa  68.2  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  31.97 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83452  predicted protein  28.48 
 
 
403 aa  67.4  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 
261 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1553  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.63 
 
 
285 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.356891  normal  0.142673 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0716  hypothetical protein  33.54 
 
 
277 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  28.18 
 
 
890 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7210  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
538 aa  64.3  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0534187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.33 
 
 
648 aa  63.9  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
431 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32992  metacaspase  31.58 
 
 
633 aa  63.5  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.696617  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3184  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.55 
 
 
343 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000598949 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3429  hypothetical protein  33.86 
 
 
609 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.74 
 
 
1316 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3074  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.86 
 
 
612 aa  61.6  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0393435  normal  0.650719 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0798  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.48 
 
 
612 aa  61.6  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2370  putative exported protease/peptidase  27.27 
 
 
208 aa  61.2  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0426298 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2381  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  41.35 
 
 
717 aa  60.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00157226 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00740  metacaspase, putative  32.78 
 
 
463 aa  60.5  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2371  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.92 
 
 
561 aa  60.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.48 
 
 
309 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6052  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.5 
 
 
538 aa  60.1  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.751143  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.51 
 
 
719 aa  60.1  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05712  Metacaspase-1 Precursor (EC 3.4.22.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8J140]  34.64 
 
 
438 aa  60.1  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131865  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.19 
 
 
324 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1323  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.68 
 
 
666 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.540466  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
711 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1373  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.76 
 
 
305 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 
711 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 
871 aa  57  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.68 
 
 
298 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.52 
 
 
590 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1486  hypothetical protein  41.03 
 
 
297 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.93 
 
 
457 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  32.86 
 
 
477 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5582  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  37.82 
 
 
641 aa  53.9  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2624  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.83 
 
 
805 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.84 
 
 
502 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0759  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.59 
 
 
789 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.795522 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03882  metacaspase, putative (JCVI)  32.68 
 
 
540 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.373127  normal  0.877993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.32 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  26.12 
 
 
900 aa  51.6  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1374  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.77 
 
 
301 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.285765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6953  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.32 
 
 
850 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  32.91 
 
 
404 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  30.92 
 
 
369 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  25.33 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.95 
 
 
830 aa  50.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.89 
 
 
1343 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02503  metacaspase (Eurofung)  30 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  25.31 
 
 
903 aa  47.8  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.11 
 
 
531 aa  47.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0016  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
288 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.01 
 
 
1731 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0296  hypothetical protein  34.21 
 
 
671 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.28 
 
 
1004 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
397 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 
316 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  21.38 
 
 
442 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  25 
 
 
500 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  27.68 
 
 
1160 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  24.77 
 
 
341 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
795 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.05 
 
 
795 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>