91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1560 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 316 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  45.25 
 
 		 316 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.08 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.68 
 
 		 324 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.38 
 
 		 324 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  41.52 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  39.82 
 
 		 331 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.38 
 
 		 313 aa  221  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  37.23 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.23 
 
 		 325 aa  210  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  34.18 
 
 		 1553 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.12 
 
 		 1196 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  29.2 
 
 		 902 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.33 
 
 		 1711 aa  76.3  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.24 
 
 		 1760 aa  74.7  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.64 
 
 		 890 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.91 
 
 		 1481 aa  73.6  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  30.6 
 
 		 900 aa  72.8  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.17 
 
 		 1686 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  30.47 
 
 		 903 aa  69.7  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  29.03 
 
 		 1619 aa  69.7  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  27.73 
 
 		 587 aa  69.3  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  29.02 
 
 		 898 aa  69.3  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.51 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 795 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29 
 
 		 795 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 324 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 1240 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 		 729 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.21 
 
 		 925 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  28.38 
 
 		 871 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 		 579 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.83 
 
 		 578 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.91 
 
 		 1106 aa  62.4  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.82 
 
 		 1004 aa  62.4  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.39 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.81 
 
 		 1494 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2534  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.19 
 
 		 941 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.687385  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 1557 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.7 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 		 1088 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  27.8 
 
 		 731 aa  59.3  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  26.73 
 
 		 1097 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.8 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.28 
 
 		 615 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.29 
 
 		 902 aa  57  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  29.03 
 
 		 509 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5307  KAP P-loop domain-containing protein  24.78 
 
 		 770 aa  56.2  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 1004 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.58 
 
 		 615 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  30.22 
 
 		 765 aa  55.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 477 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  26.32 
 
 		 510 aa  53.5  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.15 
 
 		 907 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6789  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.79 
 
 		 1554 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  28.88 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.71 
 
 		 1510 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3477  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 830 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00814329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.91 
 
 		 428 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  26.7 
 
 		 449 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 		 486 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 495 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 629 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  28.17 
 
 		 442 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3011  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.4 
 
 		 466 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.912982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.42 
 
 		 554 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.22 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.18 
 
 		 469 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0031  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 442 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0940426  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.14 
 
 		 1203 aa  46.6  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.78 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3501  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.22 
 
 		 445 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 479 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5561  hypothetical protein  30.98 
 
 		 619 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.27855e-47 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 		 1316 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  25.9 
 
 		 276 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.75 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  25.52 
 
 		 636 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.09 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0721  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.47 
 
 		 1831 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0557  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 		 711 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168227 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0574  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 		 711 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  27.63 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  29.27 
 
 		 388 aa  43.9  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  25.33 
 
 		 654 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.88 
 
 		 499 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  23.08 
 
 		 616 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4069  caspase-1, p20  24.33 
 
 		 482 aa  42.7  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>