More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0361 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  100 
 
 		 765 aa  1566    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0862  ATPase AAA-2 domain protein  28.67 
 
 		 848 aa  184  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0856425  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0363  ATPase AAA-2 domain protein  31.23 
 
 		 852 aa  181  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  30.58 
 
 		 855 aa  181  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5142  ATPase  30.64 
 
 		 847 aa  180  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.624262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  30.31 
 
 		 847 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  29.98 
 
 		 841 aa  178  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  29.3 
 
 		 862 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  29.22 
 
 		 834 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0335  ATPase AAA-2 domain protein  29.79 
 
 		 852 aa  175  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00535143  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8371  ATPase AAA-2 domain protein  30.45 
 
 		 850 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  28.16 
 
 		 861 aa  174  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  28.13 
 
 		 811 aa  174  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  28.88 
 
 		 846 aa  174  6.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  28.88 
 
 		 830 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  29.64 
 
 		 840 aa  173  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  29.41 
 
 		 837 aa  173  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  28.74 
 
 		 839 aa  173  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  29.46 
 
 		 830 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  30.6 
 
 		 858 aa  172  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  28.68 
 
 		 825 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  29.26 
 
 		 810 aa  172  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  28.88 
 
 		 835 aa  172  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 854 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  29.57 
 
 		 816 aa  170  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  28.72 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  28.88 
 
 		 836 aa  169  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.93 
 
 		 811 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.43 
 
 		 811 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  28.23 
 
 		 811 aa  167  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  29.82 
 
 		 854 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13629  ATP-dependent protease ATP-binding subunit clpC1  29.65 
 
 		 848 aa  167  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.1256e-30  normal  0.051762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  29.57 
 
 		 829 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  30.08 
 
 		 842 aa  166  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  29.33 
 
 		 812 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1430  ATPase  30.83 
 
 		 847 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.576172  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  28.23 
 
 		 811 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  28.51 
 
 		 811 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35440  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  27.3 
 
 		 851 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  30.12 
 
 		 847 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  30.12 
 
 		 847 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  30.47 
 
 		 844 aa  162  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  29.26 
 
 		 830 aa  162  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  30.47 
 
 		 836 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  29.35 
 
 		 866 aa  162  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  30.47 
 
 		 844 aa  162  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1419  ATPase AAA-2 domain protein  28.38 
 
 		 822 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1448  ATPase AAA-2 domain protein  28.38 
 
 		 822 aa  161  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  28.96 
 
 		 824 aa  159  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  29.75 
 
 		 834 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0595  ATPase AAA-2 domain protein  29.23 
 
 		 851 aa  160  1e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.190948  normal  0.0636488 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  27.91 
 
 		 825 aa  159  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1876  ATPase AAA-2 domain protein  28.57 
 
 		 821 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000589067 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3055  ATPase AAA-2 domain protein  29.26 
 
 		 858 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  26.89 
 
 		 818 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  29.12 
 
 		 829 aa  158  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  29.41 
 
 		 834 aa  158  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  28.28 
 
 		 843 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4738  ATPase AAA-2 domain-containing protein  28.68 
 
 		 824 aa  157  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0054  ATPase  32.65 
 
 		 792 aa  157  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000677637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  29.96 
 
 		 823 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  29.17 
 
 		 812 aa  155  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  28.12 
 
 		 859 aa  156  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3404  ATPase AAA-2 domain protein  29.77 
 
 		 843 aa  154  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0413  ATPase  26.56 
 
 		 789 aa  154  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2016  ATPase  29.22 
 
 		 847 aa  153  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.551696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  27.9 
 
 		 846 aa  153  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  29.62 
 
 		 826 aa  153  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0054  ATPase  31.78 
 
 		 792 aa  152  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000145392  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0660  Clp protease ATP-binding subunit  29.33 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.562676  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  26.69 
 
 		 862 aa  152  2e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1349  ATPase AAA-2 domain protein  31.67 
 
 		 820 aa  152  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14921  ClpC  29.33 
 
 		 855 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  28.85 
 
 		 834 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11951  ClpC  27.55 
 
 		 841 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2814  ATP-dependent chaperone ClpB  29.93 
 
 		 864 aa  151  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000672053  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1389  ATPase  29.57 
 
 		 843 aa  151  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0145089  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  27.84 
 
 		 842 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  28.41 
 
 		 851 aa  150  9e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1392  ATPase  32.02 
 
 		 791 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1731  ATPase  28.88 
 
 		 845 aa  150  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10981  ClpC  29.43 
 
 		 859 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.518332  normal  0.298944 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3573  ATPase AAA-2  27.54 
 
 		 818 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.307239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0011  ATPase AAA-2 domain protein  28.27 
 
 		 792 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  29.62 
 
 		 825 aa  150  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0024  ATPase  27.95 
 
 		 818 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000951044  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0899  ATPase AAA-2 domain protein  28.32 
 
 		 894 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000041024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  28.86 
 
 		 879 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  26.51 
 
 		 812 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  28.87 
 
 		 823 aa  149  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  29.57 
 
 		 842 aa  148  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  28.74 
 
 		 825 aa  148  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3955  ATPase  28.4 
 
 		 864 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00218534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5444  ATP-dependent chaperone ClpB  28.99 
 
 		 874 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2696  ATPase  27.13 
 
 		 862 aa  148  5e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>