28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2823 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  811    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5125  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.9 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.499707  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2058  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.07 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0306404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4190  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.71 
 
 		 265 aa  56.2  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.09 
 
 		 428 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.56 
 
 		 1203 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.79 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.77 
 
 		 1004 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  24.78 
 
 		 1619 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.53 
 
 		 464 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  23.64 
 
 		 890 aa  50.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 		 491 aa  49.7  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0128  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.02 
 
 		 1731 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.203044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.38 
 
 		 925 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  24.91 
 
 		 1097 aa  48.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  28.44 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.13 
 
 		 1004 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3246  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 309 aa  46.2  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00234507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  22.08 
 
 		 900 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0230  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.54 
 
 		 355 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0337671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.55 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 1343 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 		 316 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  21.49 
 
 		 903 aa  43.5  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.22 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6045  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.29 
 
 		 860 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.83 
 
 		 278 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  22.77 
 
 		 898 aa  42.7  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>