99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4662 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4662  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 
322 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.85 
 
 
324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0722  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  51.84 
 
 
324 aa  344  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0028  hypothetical protein  47.73 
 
 
331 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.194493 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0055  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  44.58 
 
 
316 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000868193  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1560  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  43.08 
 
 
316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3616  hypothetical protein  40.18 
 
 
328 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.666747  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0189  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.08 
 
 
313 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13750  Caspase domain-containing protein  36.2 
 
 
325 aa  231  2e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.843399  normal  0.836871 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0201  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.65 
 
 
325 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0418553  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2378  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.92 
 
 
658 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.85 
 
 
1686 aa  62.8  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
1481 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
1760 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2413  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.8 
 
 
579 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0588037  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1503  diguanylate phosphodiesterase  26.34 
 
 
731 aa  59.7  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.293201  hitchhiker  0.000197979 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.85 
 
 
1196 aa  59.7  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  29.68 
 
 
1097 aa  59.3  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1450  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
578 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0185927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2005  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
477 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000318218  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1545  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
578 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.29 
 
 
1553 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.27 
 
 
1240 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4110  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.03 
 
 
729 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.07 
 
 
1557 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0843  OmpA/MotB  27.55 
 
 
1619 aa  56.2  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.516542  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.11 
 
 
1711 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3572  diguanylate cyclase  27 
 
 
902 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.87 
 
 
1088 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2758  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.12 
 
 
501 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.224771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3617  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.86 
 
 
278 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.114842  hitchhiker  0.000813771 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2969  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.368497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  29.08 
 
 
925 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0772  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.66 
 
 
902 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.73 
 
 
1004 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.171644  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2900  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000126613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0287  polysaccharide deacetylase  24.45 
 
 
871 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1053  GUN4 domain protein  25.26 
 
 
670 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0234472 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  27.69 
 
 
654 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  23.91 
 
 
890 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1719  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.68 
 
 
515 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2760  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00577911  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  26.17 
 
 
1510 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3754  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.14 
 
 
478 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.629066  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4387  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.86 
 
 
485 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0766304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5464  caspase domain-containing protein  28.68 
 
 
499 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.689353 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1274  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26 
 
 
485 aa  50.4  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.843083  normal  0.111493 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  23.01 
 
 
898 aa  50.1  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1537  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 
1672 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000286892 
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  24.49 
 
 
509 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2223  polysaccharide deacetylase  22.57 
 
 
900 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.161248  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0825  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.99 
 
 
298 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0773  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
481 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5336  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 
495 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.053898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2313  hypothetical protein  22.57 
 
 
903 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.88432  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  24.87 
 
 
781 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  25.17 
 
 
509 aa  47.4  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1556  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.23 
 
 
486 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.388564  hitchhiker  0.00312965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2717  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.77 
 
 
657 aa  47  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.814877 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1656  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.53 
 
 
499 aa  47  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.211719  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3976  hypothetical protein  24.06 
 
 
500 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.435936  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0868  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 
1106 aa  47  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.65 
 
 
907 aa  46.6  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.96 
 
 
445 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.04 
 
 
554 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1810  hypothetical protein  28.43 
 
 
449 aa  46.2  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 
1203 aa  46.2  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4451  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 
795 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4542  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.86 
 
 
795 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4864  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.83 
 
 
1004 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188606  normal  0.603613 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2433  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.45 
 
 
445 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2466  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.76 
 
 
497 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.246743  normal  0.257462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  24.84 
 
 
510 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  34.12 
 
 
378 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1203  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.77 
 
 
979 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0815381  normal  0.647955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5030  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.61 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2982  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.47 
 
 
502 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0310724 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2399  ICE-like protease  28 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00930458  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  23.71 
 
 
636 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0752  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.37 
 
 
479 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.121113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1254  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.88 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  27.49 
 
 
587 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0361  Clp domain-containing protein  27.81 
 
 
765 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.722952  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  23.3 
 
 
654 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2384  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.85 
 
 
590 aa  43.5  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00194573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2899  ankyrin  27.34 
 
 
442 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0204269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0029  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.87 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.760745  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2823  hypothetical protein  25.22 
 
 
388 aa  43.5  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.605143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2362  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.62 
 
 
630 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0572  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.79 
 
 
421 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.4 
 
 
276 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5166  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.43 
 
 
1494 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2898  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.89 
 
 
428 aa  43.5  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.180767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1129  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
608 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0156816  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1011  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.85 
 
 
718 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.114785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2549  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.51 
 
 
489 aa  43.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98894  normal  0.217885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3116  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.98 
 
 
557 aa  42.7  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.964614 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0887  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.13 
 
 
504 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.389457  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3217  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 
531 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.86766  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>