17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0523 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0523  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  100 
 
 		 648 aa  1270    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54247  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6571  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.87 
 
 		 633 aa  66.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0867  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.33 
 
 		 491 aa  63.9  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0144143  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54872  metacaspase  27.04 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2725  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.95 
 
 		 275 aa  59.3  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.297841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1658  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.51 
 
 		 615 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0826255  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_51953  metacaspase  33.33 
 
 		 292 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1383  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.42 
 
 		 615 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.224094  hitchhiker  0.00154114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1607  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.13 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.547133  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48151  metacaspase  34.78 
 
 		 369 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1383  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.33 
 
 		 431 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0960542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0891  metacaspase  30 
 
 		 293 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2795  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.76 
 
 		 1316 aa  48.5  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45059  normal  0.111858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3436  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.32 
 
 		 654 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0303831  normal  0.42881 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_63918  predicted protein  24.38 
 
 		 378 aa  47  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54873  metacaspase  26.35 
 
 		 404 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1578  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.44 
 
 		 719 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>