More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2498 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_2498  ankyrin  100 
 
 
479 aa  978    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  38.7 
 
 
1156 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  36.36 
 
 
1585 aa  157  6e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  38.98 
 
 
1030 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  36.78 
 
 
762 aa  143  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  34.9 
 
 
321 aa  137  5e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  36.78 
 
 
426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  30.37 
 
 
2413 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  31.87 
 
 
723 aa  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  31.16 
 
 
821 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1000  ankyrin  32.19 
 
 
494 aa  130  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  35.53 
 
 
870 aa  130  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  34.63 
 
 
1402 aa  130  6e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  37.84 
 
 
490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0363  hypothetical protein  33.21 
 
 
2171 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.082224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  35.58 
 
 
337 aa  128  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08085  conserved hypothetical protein  36.98 
 
 
1021 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.130443  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  34.75 
 
 
1061 aa  125  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  30.49 
 
 
404 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  35.34 
 
 
474 aa  124  3e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  29.34 
 
 
715 aa  124  5e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  36.19 
 
 
855 aa  123  6e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0219  Ankyrin  29.66 
 
 
382 aa  121  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.41533e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  33.72 
 
 
305 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  34.22 
 
 
278 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  34.11 
 
 
1622 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1229  hypothetical protein  32.62 
 
 
1249 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0154751 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0622  Ankyrin  30.95 
 
 
711 aa  117  6e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08300  conserved hypothetical protein  34.63 
 
 
1977 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000214418 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  32.75 
 
 
790 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.33 
 
 
450 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0976  Ankyrin  36.92 
 
 
395 aa  114  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.157423  normal  0.476091 
 
 
-
 
NC_002978  WD0294  ankyrin repeat-containing protein  35.68 
 
 
541 aa  113  6e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  32.21 
 
 
954 aa  113  8.000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  30.42 
 
 
545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  32.83 
 
 
1139 aa  111  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  31.01 
 
 
891 aa  111  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  30.5 
 
 
472 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2662  ankyrin  34.09 
 
 
756 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  30.34 
 
 
483 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0871  hypothetical protein  31.03 
 
 
646 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.985956 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  31.7 
 
 
931 aa  107  5e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  31.73 
 
 
483 aa  107  7e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  31.94 
 
 
442 aa  106  8e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2481  Ankyrin  29.66 
 
 
391 aa  106  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000229526  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  32.03 
 
 
427 aa  106  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0514  ankyrin repeat-containing protein  36.36 
 
 
469 aa  105  1e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.919326  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03267  conserved hypothetical protein  32.58 
 
 
766 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.104781  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  33.45 
 
 
542 aa  105  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  31.65 
 
 
1005 aa  103  6e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  35.71 
 
 
750 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1288  hypothetical protein  30 
 
 
731 aa  102  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0920599 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3384  ankyrin  32.79 
 
 
293 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.251078 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2066  Ankyrin  33.04 
 
 
324 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000116575  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0471  Ankyrin  29.82 
 
 
249 aa  100  8e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  28.18 
 
 
345 aa  99.4  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.46 
 
 
329 aa  99.8  1e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0418  Ankyrin  27.38 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  29.15 
 
 
640 aa  99  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  34.8 
 
 
512 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  32.96 
 
 
865 aa  97.8  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1395  Ankyrin  31.75 
 
 
368 aa  97.1  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000222073  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  32.94 
 
 
1198 aa  96.3  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  31.2 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02010  proteolysis and peptidolysis-related protein, putative  40.12 
 
 
236 aa  95.5  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  29 
 
 
404 aa  95.5  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2929  peptidase M56 BlaR1  33.17 
 
 
590 aa  95.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1634  ankyrin repeat-containing protein  31.02 
 
 
1116 aa  94.4  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0269822  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0596  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  32.28 
 
 
493 aa  93.6  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0473339  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3138  ankyrin  36.93 
 
 
208 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2318  Ankyrin  29.95 
 
 
217 aa  93.2  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02994  conserved hypothetical protein  31.02 
 
 
1133 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  28.8 
 
 
574 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2661  ankyrin  31.48 
 
 
287 aa  91.3  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0806598 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  32.92 
 
 
811 aa  90.9  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  30 
 
 
581 aa  90.5  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2634  ankyrin  34.04 
 
 
269 aa  90.1  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0366745  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  26.88 
 
 
4520 aa  89.7  9e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1144  hypothetical protein  27.15 
 
 
2122 aa  89.4  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  34.57 
 
 
216 aa  89.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1283  ankyrin  29.91 
 
 
214 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27436  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5090  Ankyrin  38.84 
 
 
135 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.325044  normal  0.0672645 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10397  conserved hypothetical protein  36.05 
 
 
307 aa  88.2  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1453  TPR domain-containing protein  26.22 
 
 
344 aa  88.2  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157912  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81069  positive regulatory protein of phosphate pathway  29.8 
 
 
1302 aa  88.6  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.351661  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1108  ankyrin repeat protein  33.47 
 
 
740 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383427  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2700  hypothetical protein  30.65 
 
 
360 aa  87.8  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.57882  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4250  ankyrin  34.02 
 
 
237 aa  87.8  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0071  ankyrin repeat-containing protein  29.82 
 
 
224 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2205  Ankyrin  32.05 
 
 
191 aa  87  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00267936  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05168  NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G07030)  28.79 
 
 
1307 aa  86.7  9e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.6235  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  32.6 
 
 
1387 aa  85.5  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1844  ankyrin  30.39 
 
 
619 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3438  ankyrin  29.02 
 
 
296 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  27.72 
 
 
1800 aa  85.1  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  44.23 
 
 
583 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  37.8 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1071  hypothetical protein  32.6 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0824  ankyrin  32.98 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>