More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2357 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  100 
 
 
1081 aa  2195    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  50 
 
 
1226 aa  324  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  40.22 
 
 
1321 aa  273  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  34.06 
 
 
1710 aa  204  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  49.78 
 
 
531 aa  204  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  48.06 
 
 
920 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  42.61 
 
 
758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  47.71 
 
 
926 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  46.94 
 
 
288 aa  177  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  29.37 
 
 
1421 aa  176  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0275  S-layer domain protein  26.64 
 
 
830 aa  149  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  38.34 
 
 
223 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  41.99 
 
 
573 aa  130  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  38.73 
 
 
1009 aa  128  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  38.92 
 
 
693 aa  124  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  38.12 
 
 
1194 aa  119  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  34.16 
 
 
1821 aa  118  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  36.31 
 
 
526 aa  118  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1775  S-layer domain-containing protein  24.57 
 
 
2117 aa  118  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.83614  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  34.64 
 
 
548 aa  117  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  37.06 
 
 
921 aa  115  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  37.28 
 
 
710 aa  114  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  32.34 
 
 
506 aa  111  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  35.09 
 
 
518 aa  110  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.94 
 
 
932 aa  110  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.04 
 
 
1174 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  35.23 
 
 
685 aa  108  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  39.51 
 
 
548 aa  107  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  30.81 
 
 
4630 aa  106  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  33 
 
 
218 aa  105  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  36.69 
 
 
457 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  34.12 
 
 
1223 aa  104  8e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.36 
 
 
660 aa  104  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 
1234 aa  104  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.14 
 
 
1328 aa  103  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
1016 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.15 
 
 
935 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.28 
 
 
756 aa  103  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  35.2 
 
 
767 aa  102  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  33.33 
 
 
631 aa  102  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  35.19 
 
 
820 aa  101  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.82 
 
 
1260 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  34.43 
 
 
629 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  32.72 
 
 
625 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34.32 
 
 
1208 aa  100  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  30.52 
 
 
692 aa  99.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  30 
 
 
431 aa  98.6  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 
1029 aa  98.6  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  31.07 
 
 
506 aa  98.2  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  32.52 
 
 
693 aa  96.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  31.98 
 
 
1168 aa  96.3  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.12 
 
 
995 aa  95.9  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  36.26 
 
 
1847 aa  95.1  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  34.83 
 
 
754 aa  94.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.61 
 
 
688 aa  93.6  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  33.52 
 
 
624 aa  92.8  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.18 
 
 
2313 aa  92.8  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  29.41 
 
 
558 aa  92  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  33.54 
 
 
447 aa  91.7  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  33.74 
 
 
542 aa  91.3  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  31.03 
 
 
554 aa  91.3  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  31.03 
 
 
1013 aa  90.9  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2014  S-layer domain protein  30.39 
 
 
546 aa  90.9  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.498436  normal  0.16528 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  32.18 
 
 
2286 aa  89.4  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.62 
 
 
6885 aa  89.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  31.69 
 
 
414 aa  88.6  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  30.05 
 
 
413 aa  88.2  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 
413 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.57 
 
 
618 aa  87  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  26.86 
 
 
546 aa  87  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  30.77 
 
 
669 aa  86.3  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2693  S-layer domain protein  32.14 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  37.82 
 
 
3027 aa  84.7  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.94 
 
 
1054 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.69 
 
 
1231 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  28.48 
 
 
552 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3120  S-layer domain protein  36.15 
 
 
627 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2917  S-layer domain-containing protein  29.27 
 
 
805 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.463715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  26.52 
 
 
1495 aa  81.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3843  S-layer domain protein  32.08 
 
 
375 aa  80.1  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0089  S-layer domain protein  28.9 
 
 
807 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00025043 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  31.07 
 
 
733 aa  80.1  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0327  S-layer-like domain-containing protein  40.37 
 
 
857 aa  80.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  27.23 
 
 
585 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  29.73 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  29.73 
 
 
620 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 
1661 aa  79.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.2 
 
 
843 aa  78.6  0.0000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  29.19 
 
 
620 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0618  S-layer domain protein  27.49 
 
 
463 aa  78.2  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.631115  hitchhiker  0.0000121353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.83 
 
 
640 aa  77.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  30.1 
 
 
914 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  30.17 
 
 
524 aa  77  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2116  S-layer domain-containing protein  28.57 
 
 
748 aa  77  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.344579  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  27.75 
 
 
1154 aa  76.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  31.43 
 
 
876 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  31.69 
 
 
822 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  30.39 
 
 
2375 aa  75.5  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  31.33 
 
 
807 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4159  S-layer domain protein  29.17 
 
 
220 aa  74.3  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.767768  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>