194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3414 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 
1407 aa  2764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.38 
 
 
1453 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.76 
 
 
1451 aa  602  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  37.82 
 
 
1514 aa  566  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  61.83 
 
 
682 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  63.61 
 
 
413 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.67 
 
 
416 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  60.31 
 
 
672 aa  442  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  58.67 
 
 
381 aa  372  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  55.49 
 
 
592 aa  362  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.7 
 
 
412 aa  329  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  53.22 
 
 
429 aa  327  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 
434 aa  321  6e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.25 
 
 
423 aa  311  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  44.3 
 
 
788 aa  271  5.9999999999999995e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  47.77 
 
 
710 aa  266  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.57 
 
 
403 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.57 
 
 
403 aa  220  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  44.77 
 
 
383 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.32 
 
 
405 aa  214  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.84 
 
 
403 aa  212  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  42.66 
 
 
406 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  42.66 
 
 
406 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  42.66 
 
 
406 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  42.66 
 
 
406 aa  211  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  42.66 
 
 
406 aa  212  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  42.66 
 
 
406 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  42.66 
 
 
406 aa  211  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.84 
 
 
403 aa  211  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  42.09 
 
 
406 aa  198  6e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  38.08 
 
 
404 aa  176  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.98 
 
 
1512 aa  175  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 
1535 aa  172  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  37.04 
 
 
410 aa  172  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  33.51 
 
 
797 aa  146  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  38.46 
 
 
446 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  34.68 
 
 
511 aa  127  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  33.33 
 
 
672 aa  117  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.24 
 
 
1271 aa  104  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  37.82 
 
 
1004 aa  104  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  42 
 
 
456 aa  99  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.79 
 
 
976 aa  95.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  31.55 
 
 
553 aa  94.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.56 
 
 
312 aa  94  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  30.92 
 
 
479 aa  94  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  29.27 
 
 
527 aa  92.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
454 aa  92  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  33.45 
 
 
1762 aa  90.9  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  31.08 
 
 
534 aa  90.1  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  27.87 
 
 
334 aa  89.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 
795 aa  89.4  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  30.22 
 
 
341 aa  88.6  8e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.94 
 
 
464 aa  87.8  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  26.82 
 
 
812 aa  86.3  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.5 
 
 
990 aa  85.9  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.55 
 
 
1072 aa  85.9  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  30.79 
 
 
1308 aa  85.5  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  29.27 
 
 
280 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  31.56 
 
 
519 aa  83.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  30.65 
 
 
1270 aa  82.8  0.00000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  27.22 
 
 
1077 aa  82.4  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.51 
 
 
339 aa  82  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  29.35 
 
 
497 aa  80.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.46 
 
 
344 aa  79.7  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
461 aa  79.3  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  31.04 
 
 
519 aa  78.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.57 
 
 
445 aa  77.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  23.72 
 
 
1557 aa  76.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  31.01 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  29.21 
 
 
993 aa  75.1  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.94 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  31.75 
 
 
524 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  27.78 
 
 
693 aa  74.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  28.07 
 
 
657 aa  73.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  29.21 
 
 
776 aa  73.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  30.94 
 
 
519 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  31.34 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
529 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  29.67 
 
 
534 aa  73.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  27.63 
 
 
540 aa  72  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.58 
 
 
529 aa  72  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.58 
 
 
529 aa  72  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.35 
 
 
538 aa  71.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  30.43 
 
 
642 aa  72  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  24.8 
 
 
508 aa  72  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  36.36 
 
 
610 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  31.32 
 
 
529 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  32.04 
 
 
529 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  26.46 
 
 
998 aa  71.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  25.88 
 
 
471 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  30.58 
 
 
529 aa  71.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  26.47 
 
 
540 aa  70.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  35.83 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  35.83 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  35.83 
 
 
610 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  32.04 
 
 
577 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  30.14 
 
 
539 aa  69.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.23 
 
 
717 aa  69.3  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 
534 aa  69.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  26.61 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>