102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3227 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  100 
 
 		 446 aa  887    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  42.18 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.18 
 
 		 403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.85 
 
 		 403 aa  147  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  42.47 
 
 		 406 aa  143  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  41.49 
 
 		 383 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  41.45 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  37.5 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.16 
 
 		 405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.23 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.23 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  41.09 
 
 		 406 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  32.11 
 
 		 797 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  38.46 
 
 		 1407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  35.03 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  40 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  39.29 
 
 		 682 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  36.11 
 
 		 788 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  36.11 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.05 
 
 		 416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  30.27 
 
 		 592 aa  119  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.22 
 
 		 412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  35.21 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  36.7 
 
 		 672 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.96 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.29 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.21 
 
 		 1271 aa  99.4  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  32 
 
 		 479 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  33.72 
 
 		 534 aa  93.2  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  29.12 
 
 		 1270 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.69 
 
 		 1072 aa  85.1  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  30.94 
 
 		 672 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  30.69 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  31.45 
 
 		 539 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  29.02 
 
 		 1077 aa  80.1  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  29.51 
 
 		 1308 aa  79  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  28.61 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  28.5 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30.48 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  25.77 
 
 		 531 aa  72  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  27.5 
 
 		 534 aa  70.1  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  29.66 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.68 
 
 		 538 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  30.57 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.1 
 
 		 529 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  28.8 
 
 		 533 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  27.95 
 
 		 610 aa  63.2  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  29.97 
 
 		 577 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  30.77 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  29.97 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  27.79 
 
 		 529 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.22 
 
 		 1251 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  29.63 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  29.63 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  29.63 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  29 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  26.02 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  27.7 
 
 		 529 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  27.97 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  30.09 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.1 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.1 
 
 		 529 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  27.97 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  27.97 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  28.52 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  26.07 
 
 		 540 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  26.14 
 
 		 910 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  29.36 
 
 		 657 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  27.7 
 
 		 519 aa  57  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0860  Peptidase S53 propeptide  27.18 
 
 		 674 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.0144572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  32.84 
 
 		 577 aa  54.7  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  31.9 
 
 		 788 aa  53.9  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.45 
 
 		 1267 aa  53.1  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  30.48 
 
 		 648 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  26.39 
 
 		 553 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0002  protease-like protein  29.47 
 
 		 781 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  27.71 
 
 		 1317 aa  52.4  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.67 
 
 		 976 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 		 577 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 		 577 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  32.31 
 
 		 577 aa  51.2  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.86 
 
 		 579 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  26.22 
 
 		 579 aa  49.7  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  33.94 
 
 		 579 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  28.32 
 
 		 777 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  26.63 
 
 		 998 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  26.96 
 
 		 523 aa  47  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  25.91 
 
 		 1207 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  31.75 
 
 		 633 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  32.54 
 
 		 633 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  25.5 
 
 		 610 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  25.5 
 
 		 610 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  31.75 
 
 		 628 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>