140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6381 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  820    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  96.78 
 
 		 404 aa  784    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  56.66 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  53.43 
 
 		 406 aa  395  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.07 
 
 		 403 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.94 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.35 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.35 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.09 
 
 		 405 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  42.79 
 
 		 383 aa  236  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  38.97 
 
 		 797 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  40.57 
 
 		 682 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  38.98 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.48 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  38.11 
 
 		 381 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  37.08 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  37.04 
 
 		 1407 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  35.71 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  36.54 
 
 		 672 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  35.51 
 
 		 592 aa  170  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.8 
 
 		 434 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  35.65 
 
 		 710 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  34.92 
 
 		 534 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  35.93 
 
 		 788 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.69 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.55 
 
 		 412 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  42.42 
 
 		 446 aa  145  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.38 
 
 		 1271 aa  141  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  33.98 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  29.65 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  31.78 
 
 		 534 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.35 
 
 		 1072 aa  124  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  30.27 
 
 		 1308 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.41 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  33.7 
 
 		 788 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  31.9 
 
 		 1077 aa  117  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 529 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  33.09 
 
 		 529 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  33.66 
 
 		 529 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 		 529 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 		 529 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  33.33 
 
 		 533 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  32.04 
 
 		 553 aa  109  9.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  33.25 
 
 		 519 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  34.26 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  35.35 
 
 		 553 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  39.92 
 
 		 777 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  32.92 
 
 		 519 aa  107  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  31.03 
 
 		 658 aa  107  5e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  32.02 
 
 		 531 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  32 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  30.43 
 
 		 540 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  33.17 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  28.48 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  29.1 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  35.38 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  29.28 
 
 		 1270 aa  100  4e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  33.58 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  33.58 
 
 		 577 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  33.33 
 
 		 529 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  33.58 
 
 		 529 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  33.33 
 
 		 529 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  29.5 
 
 		 540 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  26.1 
 
 		 976 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  31.76 
 
 		 622 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  30.67 
 
 		 1073 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.69 
 
 		 1267 aa  89.7  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  32.2 
 
 		 523 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  31.11 
 
 		 1317 aa  87  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  27.27 
 
 		 657 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  29.51 
 
 		 562 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.29 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  31.03 
 
 		 534 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  26.96 
 
 		 998 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  26.47 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  26.09 
 
 		 910 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  32.57 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  32.57 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  32.57 
 
 		 562 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  29.11 
 
 		 551 aa  79.7  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  27.9 
 
 		 610 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  29.2 
 
 		 1207 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  27.37 
 
 		 626 aa  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2801  Peptidase S53 propeptide  25.32 
 
 		 606 aa  78.2  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  26.59 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  30.7 
 
 		 1027 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  31.25 
 
 		 577 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.25 
 
 		 1251 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  27.83 
 
 		 579 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.83 
 
 		 579 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  28.08 
 
 		 579 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0313  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.44 
 
 		 600 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>