149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0804 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  87.59 
 
 		 403 aa  729    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 403 aa  811    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  87.59 
 
 		 403 aa  729    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  86.67 
 
 		 405 aa  722    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  98.26 
 
 		 403 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  72.91 
 
 		 406 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  72.91 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  72.91 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  72.91 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  72.91 
 
 		 406 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  72.91 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  72.91 
 
 		 406 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  73.68 
 
 		 406 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  53.94 
 
 		 410 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  54.68 
 
 		 404 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  47.38 
 
 		 383 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  41.48 
 
 		 592 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  41.03 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  44.78 
 
 		 682 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.86 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  38.79 
 
 		 797 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  42.3 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  43.75 
 
 		 1407 aa  212  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.35 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  41.74 
 
 		 672 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.87 
 
 		 423 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.37 
 
 		 412 aa  196  8.000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  40.62 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  37.9 
 
 		 511 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  35.97 
 
 		 788 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  37.18 
 
 		 710 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  39.85 
 
 		 446 aa  146  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  35.53 
 
 		 534 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  33.07 
 
 		 1308 aa  145  8.000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.76 
 
 		 1271 aa  138  2e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.35 
 
 		 1072 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  31.05 
 
 		 479 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  34.34 
 
 		 788 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  31.96 
 
 		 539 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  34.92 
 
 		 672 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  31.34 
 
 		 527 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  29.69 
 
 		 534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  36.13 
 
 		 1077 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  35.15 
 
 		 529 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.15 
 
 		 538 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  37.97 
 
 		 777 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  29.74 
 
 		 976 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  32.49 
 
 		 658 aa  107  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 		 529 aa  106  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  33.75 
 
 		 533 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  33.51 
 
 		 524 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  37.96 
 
 		 545 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  34.9 
 
 		 529 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  31.75 
 
 		 553 aa  99.8  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.56 
 
 		 529 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.56 
 
 		 529 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  33.85 
 
 		 529 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  28.91 
 
 		 1270 aa  94  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  32.4 
 
 		 540 aa  94  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  33.07 
 
 		 577 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.49 
 
 		 464 aa  92.8  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  33.33 
 
 		 529 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  32.62 
 
 		 540 aa  92.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  34.27 
 
 		 622 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  33.07 
 
 		 529 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  33.07 
 
 		 529 aa  91.3  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  31.19 
 
 		 507 aa  90.5  5e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  34.06 
 
 		 1317 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  29.41 
 
 		 657 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 		 1267 aa  86.7  6e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  38.16 
 
 		 577 aa  86.3  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  36.23 
 
 		 562 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  33.5 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  35.51 
 
 		 582 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  35.51 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  35.51 
 
 		 562 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  28.77 
 
 		 610 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  32.75 
 
 		 519 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  31.51 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.55 
 
 		 534 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  29.37 
 
 		 998 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  31.72 
 
 		 1207 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  30.26 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  36.23 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.27 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.27 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  31.03 
 
 		 519 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  35.27 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  32.52 
 
 		 694 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  29.68 
 
 		 611 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  33.48 
 
 		 531 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.77 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.77 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.77 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  32.52 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  32.52 
 
 		 633 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29 
 
 		 1251 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  32.87 
 
 		 633 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  31.45 
 
 		 910 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  32.87 
 
 		 633 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>