143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5169 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  73.28 
 
 
524 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  74.24 
 
 
577 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  89.01 
 
 
538 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  74.62 
 
 
622 aa  760    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  90.98 
 
 
529 aa  959    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  98.31 
 
 
529 aa  1031    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  90.98 
 
 
529 aa  959    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  74.05 
 
 
529 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  74.24 
 
 
529 aa  752    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  74.05 
 
 
529 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  74.05 
 
 
529 aa  750    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  88.72 
 
 
529 aa  934    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  91.54 
 
 
529 aa  965    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  100 
 
 
533 aa  1070    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  61.1 
 
 
519 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  61.71 
 
 
519 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  61.52 
 
 
519 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  47.31 
 
 
540 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  45.85 
 
 
540 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  51.15 
 
 
553 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  47.89 
 
 
531 aa  416  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  47.76 
 
 
523 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  43.21 
 
 
507 aa  351  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  40.62 
 
 
534 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  34.96 
 
 
553 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  35.47 
 
 
551 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  35.08 
 
 
534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  31.65 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  30.41 
 
 
626 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  30.9 
 
 
577 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  28.81 
 
 
539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  30.38 
 
 
579 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  30.02 
 
 
579 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.64 
 
 
579 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  29.4 
 
 
562 aa  159  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.72 
 
 
562 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.72 
 
 
562 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  29.72 
 
 
582 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  29.81 
 
 
545 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.26 
 
 
1271 aa  152  1e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  29.33 
 
 
777 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.2 
 
 
1251 aa  143  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.52 
 
 
1073 aa  140  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  28.14 
 
 
626 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.32 
 
 
610 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.32 
 
 
610 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.32 
 
 
610 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
534 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  28.93 
 
 
611 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  29.03 
 
 
610 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  32.43 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  29.14 
 
 
1207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  32.81 
 
 
1308 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  30.02 
 
 
766 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  30.19 
 
 
766 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  30.19 
 
 
766 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  30.19 
 
 
766 aa  126  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  30.19 
 
 
644 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  30.18 
 
 
798 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  30.19 
 
 
766 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.63 
 
 
1072 aa  125  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  29.51 
 
 
644 aa  124  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  25.84 
 
 
672 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.82 
 
 
410 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  34.24 
 
 
404 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  29.51 
 
 
669 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  27.94 
 
 
694 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 
403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  31.35 
 
 
788 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 
403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.17 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.17 
 
 
403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  33.17 
 
 
406 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  26.1 
 
 
591 aa  108  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  107  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  30.66 
 
 
797 aa  107  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  27.69 
 
 
1077 aa  107  7e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  24.87 
 
 
1270 aa  106  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  27.59 
 
 
628 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  27.38 
 
 
648 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  33.6 
 
 
1027 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.39 
 
 
416 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
464 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  30.79 
 
 
592 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  31.88 
 
 
413 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>