164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0766 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  100 
 
 
788 aa  1569    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  77.58 
 
 
777 aa  1188    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  44.38 
 
 
611 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  44.76 
 
 
610 aa  372  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.69 
 
 
534 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  44.26 
 
 
610 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  44.26 
 
 
610 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  44.26 
 
 
610 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  43.07 
 
 
582 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  42.88 
 
 
562 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  42.88 
 
 
562 aa  343  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  41.77 
 
 
562 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
577 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.95 
 
 
577 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  41.95 
 
 
577 aa  331  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  41.57 
 
 
577 aa  330  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  41.6 
 
 
579 aa  321  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.6 
 
 
579 aa  320  7e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  40.39 
 
 
694 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  40.57 
 
 
633 aa  316  9e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  40.57 
 
 
633 aa  316  9e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  40.93 
 
 
628 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  40.93 
 
 
633 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  39.55 
 
 
579 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  40.75 
 
 
633 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  40.57 
 
 
633 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  40.57 
 
 
633 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  39.86 
 
 
644 aa  298  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  40 
 
 
766 aa  286  8e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  40 
 
 
766 aa  286  8e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  40 
 
 
766 aa  286  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  40 
 
 
766 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  39.89 
 
 
644 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  40 
 
 
798 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  39.13 
 
 
669 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  39.82 
 
 
766 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  33 
 
 
534 aa  169  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  29.07 
 
 
539 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  32.51 
 
 
507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.71 
 
 
1271 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  28.91 
 
 
524 aa  147  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  31.25 
 
 
545 aa  145  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1091  curculin-like (mannose-binding) lectin  43.42 
 
 
298 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000304641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1571  curculin domain-containing protein  43.42 
 
 
298 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00304753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1547  curculin domain-containing protein  43.42 
 
 
298 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000198605  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  42.11 
 
 
374 aa  140  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  30.13 
 
 
553 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4524  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 
226 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.465524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  28.82 
 
 
529 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  29.77 
 
 
540 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  30.56 
 
 
540 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  28.63 
 
 
577 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  28.43 
 
 
529 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  28.43 
 
 
529 aa  134  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  33.33 
 
 
406 aa  134  9e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  28.43 
 
 
529 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  28.21 
 
 
519 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.04 
 
 
405 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.51 
 
 
403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.42 
 
 
403 aa  131  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.77 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.77 
 
 
403 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  35.56 
 
 
406 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  29.45 
 
 
519 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  29.06 
 
 
1308 aa  125  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  29.37 
 
 
519 aa  125  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  28.98 
 
 
529 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.93 
 
 
410 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  28.01 
 
 
529 aa  124  7e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.5 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
529 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.98 
 
 
529 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  25.6 
 
 
626 aa  121  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  32.72 
 
 
553 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  24.65 
 
 
976 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  27.74 
 
 
622 aa  118  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0927  Curculin domain protein (mannose-binding) lectin  55 
 
 
511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  33.08 
 
 
404 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  31.5 
 
 
533 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
538 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  24.55 
 
 
672 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1092  curculin-like (mannose-binding) lectin  38.43 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000112862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1572  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000136518  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1548  curculin domain-containing protein  38.43 
 
 
270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000000088677  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  48.51 
 
 
152 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.95 
 
 
1267 aa  109  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  26.21 
 
 
1207 aa  108  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  28.93 
 
 
531 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  28.95 
 
 
523 aa  106  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  24.84 
 
 
626 aa  106  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  28.14 
 
 
1027 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  33.42 
 
 
710 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  30.38 
 
 
413 aa  101  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  33.07 
 
 
788 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>