143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4988 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  74.04 
 
 
524 aa  761    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  75 
 
 
577 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  90.71 
 
 
538 aa  943    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  74.81 
 
 
622 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  99.43 
 
 
529 aa  1057    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  92.05 
 
 
529 aa  967    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  99.43 
 
 
529 aa  1057    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  74.81 
 
 
529 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  75 
 
 
529 aa  758    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  75.19 
 
 
529 aa  760    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  74.81 
 
 
529 aa  755    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  89.22 
 
 
529 aa  938    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  100 
 
 
529 aa  1063    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  91.54 
 
 
533 aa  950    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  60.42 
 
 
519 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  61.42 
 
 
519 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  61.42 
 
 
519 aa  597  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  47.1 
 
 
540 aa  465  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  46.39 
 
 
540 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  51.27 
 
 
553 aa  442  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  48.65 
 
 
531 aa  425  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  44.68 
 
 
507 aa  362  8e-99  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  46.71 
 
 
523 aa  344  2e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  41.36 
 
 
534 aa  330  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  35.95 
 
 
553 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  35.47 
 
 
551 aa  200  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  34.63 
 
 
534 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  31.29 
 
 
626 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 
577 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.69 
 
 
577 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  31.69 
 
 
577 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  30.73 
 
 
579 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.49 
 
 
579 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  30.42 
 
 
579 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  30.7 
 
 
577 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  29.72 
 
 
562 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.66 
 
 
562 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.66 
 
 
562 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  30.3 
 
 
582 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  27.92 
 
 
539 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.26 
 
 
1271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  29.92 
 
 
545 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.72 
 
 
1073 aa  143  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  30.31 
 
 
610 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  29.55 
 
 
777 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.49 
 
 
534 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  29.93 
 
 
611 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.95 
 
 
610 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.95 
 
 
610 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.95 
 
 
610 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.45 
 
 
1251 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.61 
 
 
1072 aa  137  5e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.6 
 
 
1207 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  33.54 
 
 
1308 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  32.77 
 
 
534 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  29.14 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  28.5 
 
 
694 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  29.76 
 
 
626 aa  127  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  29.4 
 
 
766 aa  126  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  29.25 
 
 
644 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  29.4 
 
 
766 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  29.4 
 
 
766 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  29.4 
 
 
766 aa  125  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  29.23 
 
 
798 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  29.4 
 
 
766 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  34.22 
 
 
404 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  29.39 
 
 
669 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.58 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  28.52 
 
 
788 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  117  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  24.96 
 
 
1270 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  28.5 
 
 
628 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  28.5 
 
 
633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  28.73 
 
 
1077 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  32.66 
 
 
406 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  32.66 
 
 
406 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  32.66 
 
 
406 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  32.66 
 
 
406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  32.66 
 
 
406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  32.66 
 
 
406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  32.66 
 
 
406 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0081  Peptidase S53 propeptide  28.21 
 
 
696 aa  110  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  36.49 
 
 
797 aa  110  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.5 
 
 
403 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33 
 
 
405 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0196  Peptidase S53 propeptide  27.7 
 
 
695 aa  107  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.79 
 
 
403 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  25.28 
 
 
1223 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.75 
 
 
403 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.75 
 
 
403 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  27.58 
 
 
658 aa  105  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  32.23 
 
 
413 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  31.41 
 
 
406 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.12 
 
 
416 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  30.28 
 
 
592 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 
464 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>