140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3301 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  78.73 
 
 		 582 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  90.85 
 
 		 577 aa  1058    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  79.14 
 
 		 562 aa  904    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  92.92 
 
 		 577 aa  1082    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 579 aa  1172    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  92.92 
 
 		 577 aa  1082    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  79.68 
 
 		 562 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  79.68 
 
 		 562 aa  906    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  89.98 
 
 		 579 aa  1049    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  92.92 
 
 		 577 aa  1082    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  99.31 
 
 		 579 aa  1167    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  51.47 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  51.47 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  51.47 
 
 		 610 aa  511  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  51.82 
 
 		 610 aa  505  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  50.42 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.79 
 
 		 534 aa  497  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  46.78 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  46.78 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  46.78 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  46.78 
 
 		 766 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  46.78 
 
 		 798 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  47.18 
 
 		 644 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  46.62 
 
 		 766 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  45.47 
 
 		 694 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  45.2 
 
 		 669 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  45.27 
 
 		 644 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  45.64 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  45.97 
 
 		 633 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  45.64 
 
 		 633 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  45.97 
 
 		 628 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  45.81 
 
 		 633 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  45.64 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  45.64 
 
 		 633 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  40.52 
 
 		 777 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  39.74 
 
 		 788 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0435  serine protease  79.86 
 
 		 152 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  30.32 
 
 		 534 aa  163  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  31.34 
 
 		 622 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  29.8 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  31.7 
 
 		 545 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  29.74 
 
 		 529 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  30.54 
 
 		 529 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  30.35 
 
 		 577 aa  153  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  30.35 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  30.5 
 
 		 529 aa  152  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  30.17 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  30.17 
 
 		 529 aa  151  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.14 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.38 
 
 		 529 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  27.46 
 
 		 1223 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 		 538 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  30.51 
 
 		 553 aa  146  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  30.69 
 
 		 519 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  28.96 
 
 		 533 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  30.77 
 
 		 519 aa  140  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  29.96 
 
 		 540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  30.06 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  28.35 
 
 		 626 aa  134  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.85 
 
 		 1207 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  30.79 
 
 		 507 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  29.54 
 
 		 540 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.65 
 
 		 1271 aa  129  2.0000000000000002e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  28.86 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  28.26 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  27.83 
 
 		 672 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  25.21 
 
 		 626 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 		 1251 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  29.03 
 
 		 1027 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  25.05 
 
 		 534 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  26.18 
 
 		 658 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  27.63 
 
 		 1308 aa  102  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  24.64 
 
 		 1478 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  34.33 
 
 		 553 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  26.33 
 
 		 1073 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.39 
 
 		 976 aa  94.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2356  serine protease  52.94 
 
 		 190 aa  93.6  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0461112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  26.02 
 
 		 1077 aa  91.3  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  27.06 
 
 		 523 aa  87.4  6e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  26.43 
 
 		 534 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.97 
 
 		 1072 aa  83.6  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  27.47 
 
 		 551 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.43 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  25.04 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 		 1267 aa  80.5  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  30.96 
 
 		 682 aa  78.2  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.43 
 
 		 1193 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  26.33 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0081  Peptidase S53 propeptide  27.3 
 
 		 696 aa  77.8  0.0000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  27.83 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  22.86 
 
 		 1270 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  28.94 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0196  Peptidase S53 propeptide  27.41 
 
 		 695 aa  75.1  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04349  protease  33.51 
 
 		 196 aa  75.5  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.95 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2801  Peptidase S53 propeptide  24.11 
 
 		 606 aa  71.2  0.00000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  27.54 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  25.21 
 
 		 998 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>