142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4778 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  65.12 
 
 		 524 aa  667    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  65.96 
 
 		 577 aa  658    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  64.6 
 
 		 622 aa  652    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  91.52 
 
 		 519 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  65.76 
 
 		 529 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  65.76 
 
 		 529 aa  657    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  66.15 
 
 		 529 aa  662    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  65.76 
 
 		 529 aa  658    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  74.62 
 
 		 519 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  100 
 
 		 519 aa  1048    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  63.34 
 
 		 529 aa  633  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  63.53 
 
 		 529 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  62.96 
 
 		 529 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.57 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.57 
 
 		 529 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  63.24 
 
 		 533 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.08 
 
 		 538 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  53.62 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  50.58 
 
 		 540 aa  491  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  49.52 
 
 		 540 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  49.24 
 
 		 531 aa  462  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  45.3 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  42.15 
 
 		 534 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  42.53 
 
 		 523 aa  342  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  37.61 
 
 		 553 aa  263  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  34.51 
 
 		 551 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  33.2 
 
 		 534 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  30.74 
 
 		 626 aa  188  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.24 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.24 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  32.24 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  31.66 
 
 		 577 aa  171  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  30.58 
 
 		 562 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  31.24 
 
 		 579 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  31.68 
 
 		 545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  30 
 
 		 582 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.62 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  30 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  30 
 
 		 562 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  30.62 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  28.6 
 
 		 626 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  29.29 
 
 		 539 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.61 
 
 		 1271 aa  145  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 		 534 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  29.81 
 
 		 611 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  29.96 
 
 		 610 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  30.27 
 
 		 777 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.6 
 
 		 610 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.6 
 
 		 610 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.6 
 
 		 610 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  29.18 
 
 		 788 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  30.55 
 
 		 534 aa  134  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.69 
 
 		 1251 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  28.42 
 
 		 658 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  27.14 
 
 		 694 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.05 
 
 		 1207 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  33.92 
 
 		 404 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.66 
 
 		 410 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  32.04 
 
 		 1073 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  27.42 
 
 		 591 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  27.32 
 
 		 672 aa  121  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  27.13 
 
 		 644 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.8 
 
 		 1072 aa  119  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.25 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  33.9 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.03 
 
 		 464 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  27.4 
 
 		 766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  27.4 
 
 		 766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  27.4 
 
 		 766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  27.4 
 
 		 766 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  27.4 
 
 		 798 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  27.11 
 
 		 628 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  27.16 
 
 		 669 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  27.11 
 
 		 633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  27.23 
 
 		 644 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  27.23 
 
 		 766 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  28.83 
 
 		 1077 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  32.89 
 
 		 1308 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  32.69 
 
 		 710 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  32.3 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  37.37 
 
 		 406 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.76 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  32.41 
 
 		 788 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  38.23 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  38.23 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  38.23 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 		 403 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  38.23 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  38.23 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  38.23 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  38.23 
 
 		 406 aa  103  9e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  33.67 
 
 		 1027 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  35.49 
 
 		 797 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  33.33 
 
 		 672 aa  98.2  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  24.84 
 
 		 1223 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>