123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3445 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  100 
 
 
626 aa  1266    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  37.66 
 
 
626 aa  360  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0081  Peptidase S53 propeptide  32.95 
 
 
696 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0196  Peptidase S53 propeptide  32.78 
 
 
695 aa  243  7e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  31.15 
 
 
534 aa  183  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  30.82 
 
 
524 aa  180  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  31.16 
 
 
577 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  31.2 
 
 
529 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  30.99 
 
 
529 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  30.99 
 
 
529 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  30.96 
 
 
553 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  30.82 
 
 
529 aa  173  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  30.39 
 
 
531 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  30.48 
 
 
622 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  28.82 
 
 
529 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  28.82 
 
 
519 aa  156  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  31.73 
 
 
553 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  28.72 
 
 
529 aa  153  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.82 
 
 
529 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  29.9 
 
 
1073 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.55 
 
 
529 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.55 
 
 
529 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  28.36 
 
 
507 aa  148  4.0000000000000006e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  28.93 
 
 
519 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  28.47 
 
 
533 aa  143  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  28.38 
 
 
610 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  28.38 
 
 
611 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  26.88 
 
 
540 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
538 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.15 
 
 
534 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  26.64 
 
 
540 aa  140  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  27.65 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  27.65 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  27.65 
 
 
610 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.87 
 
 
1251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  28.28 
 
 
534 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  27.37 
 
 
672 aa  133  7.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.33 
 
 
1271 aa  133  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  26.11 
 
 
577 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  28.1 
 
 
519 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  25.81 
 
 
1207 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  30.49 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  25.46 
 
 
579 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.71 
 
 
577 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.71 
 
 
577 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  24.71 
 
 
577 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  25.55 
 
 
579 aa  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.55 
 
 
579 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0459  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 
1193 aa  124  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245222  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  25.29 
 
 
582 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  25.29 
 
 
562 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  25.29 
 
 
562 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  27.78 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  27.78 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  27.43 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  27.43 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  27.43 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  27.43 
 
 
766 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  27.43 
 
 
798 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  26.69 
 
 
1223 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  28.13 
 
 
633 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  28.13 
 
 
633 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  27.27 
 
 
644 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  28.13 
 
 
633 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  27.27 
 
 
766 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  24.54 
 
 
562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  26.99 
 
 
694 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  29.95 
 
 
658 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  27.77 
 
 
628 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  27.67 
 
 
1478 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  29.87 
 
 
648 aa  115  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  27.95 
 
 
644 aa  114  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  27.59 
 
 
633 aa  114  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  26.75 
 
 
669 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  29.05 
 
 
1027 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  26.89 
 
 
976 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  28.03 
 
 
523 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.46 
 
 
1267 aa  106  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  26.64 
 
 
777 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  25.59 
 
 
788 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2801  Peptidase S53 propeptide  25 
 
 
606 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  24.55 
 
 
539 aa  98.6  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  25.98 
 
 
610 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  26.67 
 
 
657 aa  94  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0313  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
600 aa  87.8  5e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  26.33 
 
 
551 aa  87  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5805  Peptidase S53 propeptide  27.6 
 
 
998 aa  84.7  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1679  protease-like  29.25 
 
 
1037 aa  75.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000116915 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.48 
 
 
1072 aa  75.5  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  23.6 
 
 
1270 aa  73.6  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8226  Peptidase S53 propeptide  24.74 
 
 
575 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.366531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  29 
 
 
527 aa  72.4  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.41 
 
 
464 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  25.7 
 
 
1317 aa  70.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  25.05 
 
 
1199 aa  70.5  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0860  Peptidase S53 propeptide  37.89 
 
 
674 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.0144572 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  23.38 
 
 
591 aa  69.3  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  24.27 
 
 
534 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0002  protease-like protein  29.41 
 
 
781 aa  68.6  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  24.63 
 
 
1308 aa  67.8  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>