142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1994 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  64.73 
 
 
524 aa  665    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  65.38 
 
 
577 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  64.02 
 
 
622 aa  645    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  100 
 
 
519 aa  1048    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  65.18 
 
 
529 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  65.38 
 
 
529 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  65.57 
 
 
529 aa  659    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  65.18 
 
 
529 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  63.53 
 
 
529 aa  636    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  73.46 
 
 
519 aa  769    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  91.52 
 
 
519 aa  932    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  63.34 
 
 
529 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  62.76 
 
 
529 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.38 
 
 
529 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  62.38 
 
 
529 aa  621  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  62.86 
 
 
533 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.7 
 
 
538 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  54.01 
 
 
553 aa  503  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  49.42 
 
 
540 aa  478  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  48.95 
 
 
540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  49.91 
 
 
531 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  44.34 
 
 
507 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  42.36 
 
 
534 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  42.99 
 
 
523 aa  343  4e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  38.03 
 
 
553 aa  264  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  34.34 
 
 
551 aa  224  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  32.1 
 
 
534 aa  190  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  30.81 
 
 
626 aa  183  6e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.73 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  31.73 
 
 
577 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  33.27 
 
 
579 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  32.25 
 
 
577 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.33 
 
 
579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  31.07 
 
 
579 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  30.19 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  33.2 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  29.81 
 
 
582 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.81 
 
 
562 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.81 
 
 
562 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  30.02 
 
 
777 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  29.85 
 
 
611 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.04 
 
 
534 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  29.57 
 
 
610 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  28.73 
 
 
539 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  27.6 
 
 
626 aa  144  4e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.92 
 
 
1271 aa  142  9.999999999999999e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.31 
 
 
610 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.31 
 
 
610 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.31 
 
 
610 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  28.52 
 
 
788 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
1251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  34.99 
 
 
404 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  34.24 
 
 
410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  27.78 
 
 
644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  29.39 
 
 
658 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  28.72 
 
 
766 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  28.72 
 
 
766 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  28.72 
 
 
766 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  28.72 
 
 
766 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  28.72 
 
 
798 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  28.35 
 
 
694 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  29.41 
 
 
534 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  28.55 
 
 
644 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  28.67 
 
 
669 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  28.55 
 
 
766 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  25.71 
 
 
672 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.26 
 
 
1207 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.44 
 
 
464 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  33.33 
 
 
592 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  28.37 
 
 
591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.56 
 
 
1073 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  28.25 
 
 
633 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  28.25 
 
 
633 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  32.34 
 
 
1308 aa  113  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  28.42 
 
 
633 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  28.08 
 
 
628 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  28.42 
 
 
633 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  28.42 
 
 
633 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  28 
 
 
633 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  34.68 
 
 
406 aa  109  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.47 
 
 
1072 aa  108  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.41 
 
 
416 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  32.59 
 
 
710 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  28.24 
 
 
1077 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.25 
 
 
403 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.75 
 
 
403 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  32.31 
 
 
788 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  31.31 
 
 
413 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  36.86 
 
 
797 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  34.94 
 
 
406 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  34.94 
 
 
406 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  34.94 
 
 
406 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  34.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  34.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  34.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  34.61 
 
 
406 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.58 
 
 
405 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  34.44 
 
 
381 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  24.52 
 
 
1223 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>