143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4640 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  73.46 
 
 		 524 aa  760    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  74.42 
 
 		 577 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  88.27 
 
 		 538 aa  918    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  74.62 
 
 		 622 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  91.48 
 
 		 529 aa  964    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 		 529 aa  1063    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  91.48 
 
 		 529 aa  964    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  74.23 
 
 		 529 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  74.42 
 
 		 529 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  74.23 
 
 		 529 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  74.23 
 
 		 529 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  88.83 
 
 		 529 aa  935    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  92.05 
 
 		 529 aa  970    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  98.31 
 
 		 533 aa  1016    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  61.38 
 
 		 519 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  62 
 
 		 519 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  62 
 
 		 519 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  47.48 
 
 		 540 aa  468  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  46.01 
 
 		 540 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  51.16 
 
 		 553 aa  440  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  48.26 
 
 		 531 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  48.15 
 
 		 523 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  43.35 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  40.59 
 
 		 534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  35.04 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  35.29 
 
 		 551 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  35.27 
 
 		 534 aa  195  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.4 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.4 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  31.4 
 
 		 577 aa  177  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  30.61 
 
 		 626 aa  176  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  30.92 
 
 		 579 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  30.43 
 
 		 577 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  30.34 
 
 		 562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 		 579 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  29.82 
 
 		 579 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  28.99 
 
 		 539 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  30.28 
 
 		 582 aa  156  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  30.28 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  30.28 
 
 		 562 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.09 
 
 		 1271 aa  155  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  29.43 
 
 		 545 aa  146  8.000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 		 1251 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  29.31 
 
 		 777 aa  146  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.55 
 
 		 1073 aa  140  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  29.9 
 
 		 1207 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  34.15 
 
 		 1308 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 		 534 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  29.03 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.32 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.32 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.32 
 
 		 610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  28.68 
 
 		 611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  30.53 
 
 		 766 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  30.38 
 
 		 644 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  30.7 
 
 		 798 aa  130  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  30.7 
 
 		 766 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  30.37 
 
 		 766 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  30.53 
 
 		 766 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  32.57 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  30.54 
 
 		 766 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  29.69 
 
 		 644 aa  127  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  29.86 
 
 		 669 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  28.14 
 
 		 694 aa  127  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.83 
 
 		 1072 aa  126  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  25.19 
 
 		 672 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.82 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  28.27 
 
 		 626 aa  123  9e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  34.4 
 
 		 404 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  31.34 
 
 		 788 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 		 403 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  114  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  27.79 
 
 		 628 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.74 
 
 		 403 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  27.79 
 
 		 633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.01 
 
 		 405 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  25.04 
 
 		 1270 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  28.16 
 
 		 1077 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 406 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 		 403 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.75 
 
 		 403 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  33.67 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.85 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  27.84 
 
 		 658 aa  104  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  30.41 
 
 		 797 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  25.83 
 
 		 591 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  23.32 
 
 		 1478 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0098  protease-like  24.88 
 
 		 1223 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.34808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  27.32 
 
 		 648 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  27.4 
 
 		 1317 aa  101  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>