142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5054 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  63.39 
 
 
524 aa  646    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  64.04 
 
 
577 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  72.12 
 
 
519 aa  743    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  63.85 
 
 
529 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  64.04 
 
 
529 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  63.85 
 
 
529 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  63.85 
 
 
529 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  100 
 
 
519 aa  1048    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  72.88 
 
 
519 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  62.31 
 
 
622 aa  624  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  61.38 
 
 
529 aa  615  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  60.99 
 
 
529 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  60.99 
 
 
529 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.61 
 
 
529 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  60.61 
 
 
529 aa  610  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  61.1 
 
 
533 aa  601  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  59.59 
 
 
538 aa  588  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  53.11 
 
 
553 aa  497  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  49.81 
 
 
540 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  49.71 
 
 
540 aa  481  1e-134  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  49.81 
 
 
531 aa  460  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  46.65 
 
 
507 aa  408  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  44.48 
 
 
534 aa  389  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  43.96 
 
 
523 aa  330  4e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  38.99 
 
 
553 aa  270  4e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  34.34 
 
 
551 aa  231  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  34.77 
 
 
534 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  30.38 
 
 
626 aa  182  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
577 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.95 
 
 
577 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3604  peptidase S53 propeptide  32.95 
 
 
577 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  32.76 
 
 
577 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  32.37 
 
 
579 aa  167  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  29.79 
 
 
562 aa  163  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  29.98 
 
 
582 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.15 
 
 
579 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  31.15 
 
 
579 aa  161  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  29.79 
 
 
562 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  29.79 
 
 
562 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3445  Peptidase S53 propeptide  27.62 
 
 
626 aa  156  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  33.12 
 
 
545 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.82 
 
 
1271 aa  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  29.81 
 
 
611 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  28.99 
 
 
539 aa  144  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.63 
 
 
534 aa  143  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  29.64 
 
 
694 aa  143  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  29.92 
 
 
777 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  29.47 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  29.02 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  29.02 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  29.02 
 
 
610 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1080  sedolisin-B  29.04 
 
 
766 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.863455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1532  serine protease  29.04 
 
 
766 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.481575  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2829  pseudomonalisin  29.04 
 
 
766 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.672339  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2682  serine protease, subtilase family protein  29.04 
 
 
766 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0111  serine protease, subtilase family protein  29.04 
 
 
798 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0093  serine protease  28.87 
 
 
644 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1253  serine protease, subtilase family protein  28.87 
 
 
766 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  30.36 
 
 
534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1564  sedolisin-B  28.42 
 
 
644 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220586 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0399  serine protease  28.7 
 
 
669 aa  137  5e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.01 
 
 
1251 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  28.99 
 
 
788 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.99 
 
 
1072 aa  132  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1538  serine protease  29.11 
 
 
633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00041451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2037  serine protease  29.11 
 
 
633 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00522948  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2563  serine protease  28.39 
 
 
633 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26958  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2417  serine protease  28.39 
 
 
633 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000170912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2473  serine protease  28.39 
 
 
628 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3274  serine protease  28.39 
 
 
633 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000323392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1309  serine protease  28.39 
 
 
633 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000244171  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  31.02 
 
 
1073 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  28.07 
 
 
1077 aa  118  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  33.99 
 
 
1308 aa  117  6e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  29.86 
 
 
591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  33.67 
 
 
410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  28.54 
 
 
1207 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  33.67 
 
 
404 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.53 
 
 
464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  33.88 
 
 
592 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  25.49 
 
 
672 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  26.68 
 
 
658 aa  106  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0105  protease-like  24.72 
 
 
1478 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.34808 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  25.88 
 
 
1270 aa  104  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  33.25 
 
 
406 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07159  hypothetical tripeptidyl-peptidase (Eurofung)  25.26 
 
 
658 aa  98.2  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.112468  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03020  tripeptidyl peptidase SED3 (AFU_orthologue; AFUA_3G08930)  25.77 
 
 
1068 aa  97.8  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0081  Peptidase S53 propeptide  26.79 
 
 
696 aa  98.2  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  34.09 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  34.01 
 
 
797 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  27.31 
 
 
1027 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  34.09 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  34.09 
 
 
406 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  26.46 
 
 
657 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.45 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  34.27 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>