131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3662 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  100 
 
 
797 aa  1541    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  46.23 
 
 
511 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  227  7e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  40.94 
 
 
406 aa  226  9e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  39.63 
 
 
406 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.84 
 
 
403 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.84 
 
 
403 aa  217  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.37 
 
 
403 aa  217  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.37 
 
 
403 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  39.95 
 
 
404 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  39.19 
 
 
410 aa  212  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.64 
 
 
405 aa  212  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  34.41 
 
 
672 aa  192  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  37.23 
 
 
413 aa  170  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  36.36 
 
 
682 aa  165  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  36.7 
 
 
429 aa  162  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  37.77 
 
 
381 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  30.11 
 
 
592 aa  148  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  33.51 
 
 
1407 aa  145  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  31.37 
 
 
788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  35.49 
 
 
383 aa  142  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 
416 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.01 
 
 
412 aa  139  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  34.49 
 
 
446 aa  135  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  31.86 
 
 
710 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.47 
 
 
434 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  31.97 
 
 
534 aa  122  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.52 
 
 
423 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.35 
 
 
1271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  29.76 
 
 
1308 aa  108  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  33.45 
 
 
539 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 
529 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.15 
 
 
529 aa  104  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  35.81 
 
 
529 aa  102  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  27.04 
 
 
672 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  33.67 
 
 
524 aa  96.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
529 aa  96.3  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  28.54 
 
 
479 aa  96.3  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  28.04 
 
 
527 aa  95.9  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  35 
 
 
529 aa  95.9  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  32.65 
 
 
540 aa  95.5  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  37.39 
 
 
788 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 
464 aa  94.7  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.26 
 
 
1072 aa  95.1  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  30.17 
 
 
533 aa  94.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  33.1 
 
 
540 aa  94  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  34.78 
 
 
531 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  36.9 
 
 
777 aa  92  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  30.39 
 
 
553 aa  91.3  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  33.25 
 
 
529 aa  89.7  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  27.81 
 
 
1077 aa  89  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  33 
 
 
577 aa  89  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  29.42 
 
 
553 aa  89  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  34.46 
 
 
507 aa  89.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.47 
 
 
976 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.21 
 
 
538 aa  88.6  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  29.7 
 
 
534 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  29.17 
 
 
523 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  31.54 
 
 
622 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  32.76 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  32.76 
 
 
529 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  32.51 
 
 
529 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  34.69 
 
 
519 aa  84.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  32.66 
 
 
519 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  34.13 
 
 
519 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  27.74 
 
 
1270 aa  77.4  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6805  protease-like protein  25.55 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.40493  normal  0.267322 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  31.27 
 
 
534 aa  75.1  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  31.16 
 
 
1779 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  28.9 
 
 
1317 aa  71.6  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  31.14 
 
 
545 aa  71.2  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  32.05 
 
 
2636 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0002  protease-like protein  27.05 
 
 
781 aa  68.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  28.02 
 
 
1073 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  26.57 
 
 
658 aa  67  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
1267 aa  66.6  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1759  kumamolisin  28.94 
 
 
551 aa  65.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.68 
 
 
1879 aa  63.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6409  Peptidase S53 propeptide  30.72 
 
 
1027 aa  61.6  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.276013 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.64 
 
 
534 aa  61.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0057  Peptidase S53 propeptide  25.14 
 
 
626 aa  61.2  0.00000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  35.08 
 
 
562 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  31.91 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  31.91 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  31.91 
 
 
610 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  30.86 
 
 
611 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  31.52 
 
 
610 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3817  peptidase S53 propeptide  32.11 
 
 
579 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0534043  normal  0.750552 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  32.98 
 
 
562 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  32.98 
 
 
562 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  32.98 
 
 
582 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
579 aa  58.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8673  Peptidase S53 propeptide  24.74 
 
 
657 aa  58.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032091  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  31.05 
 
 
577 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
577 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>