125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1577 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1577  protease-like  100 
 
 		 511 aa  1021    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3662  Ig family protein  48.49 
 
 		 797 aa  348  2e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.413571  normal  0.157157 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0814  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.05 
 
 		 403 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0804  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.78 
 
 		 403 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.865486  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.21 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0945  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.21 
 
 		 403 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2163  serine protease  39.68 
 
 		 406 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0313892  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3113  hypothetical protein  39.68 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0748  serine protease  39.68 
 
 		 406 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2582  serine protease  39.68 
 
 		 406 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3032  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.924018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3086  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2032  putative lipoprotein  39.68 
 
 		 406 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0907  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 405 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6381  hypothetical protein  38.64 
 
 		 410 aa  207  5e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.991475  normal  0.132587 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1519  serine protease  38.68 
 
 		 406 aa  205  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000201764  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6083  hypothetical protein  37.53 
 
 		 404 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.56904  normal  0.805208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0418  protease-like protein  38.84 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.971543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0417  Ig family protein  35.41 
 
 		 592 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  36.31 
 
 		 682 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2169  putative lipoprotein  38.89 
 
 		 383 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3631  serine protease  35.71 
 
 		 381 aa  157  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.523915  normal  0.916295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0446  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.5 
 
 		 412 aa  153  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3227  protease-like protein  39.93 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000167214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  35.87 
 
 		 1407 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4148  Ig family protein  36.31 
 
 		 788 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0784592  normal  0.172989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1967  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.88 
 
 		 416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7207  Ig family protein  36.12 
 
 		 710 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  33.78 
 
 		 672 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4712  serine protease  32.5 
 
 		 429 aa  144  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6111  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 		 423 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0242933 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0247  Peptidase S53 propeptide  32.46 
 
 		 534 aa  126  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2911  Peptidase S53 propeptide  30.95 
 
 		 1077 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0361  Peptidase S53 propeptide  30.45 
 
 		 1308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0637543  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5453  Peptidase S53 propeptide  33.68 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.552713 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1369  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 		 1271 aa  99  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.255631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0705  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.85 
 
 		 1072 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.276754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.74 
 
 		 538 aa  97.8  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5169  peptidase S53 propeptide  30.68 
 
 		 533 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0909191 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4640  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 		 529 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3141  physarolisin II  28.26 
 
 		 672 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4988  peptidase S53 propeptide  29.13 
 
 		 529 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1326  Peptidase S53 propeptide  27.68 
 
 		 540 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.424218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5280  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.88 
 
 		 529 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.528674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1568  serine protease, kumamolysin  31.25 
 
 		 524 aa  89.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1899  protease-like protein  27.59 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3441  peptidase S53 propeptide  29.48 
 
 		 529 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3008  Peptidase S53 propeptide  27.6 
 
 		 540 aa  87.4  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0859  serine protease  29.41 
 
 		 527 aa  86.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.444174  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0860  Peptidase S53 propeptide  28.44 
 
 		 674 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.0144572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2888  Peptidase S53 propeptide  28.38 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5919  kumamolisin  27.87 
 
 		 534 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1663  physarolisin II  29.62 
 
 		 658 aa  81.6  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.146214 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0608  kumamolisin  30.59 
 
 		 577 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2116  kumamolisin  30.59 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.229792  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2202  serine protease, kumamolysin  30.08 
 
 		 529 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.566013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2034  serine protease, kumamolysin  30.33 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0713  serine protease, kumamolysin  30.33 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2109  Peptidase S53 propeptide  27.43 
 
 		 1270 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.509088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0811  serine protease, kumamolysin  28.79 
 
 		 622 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.566172  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1589  peptidase S53 propeptide  28.61 
 
 		 1317 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.519318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0766  curculin domain-containing protein  36.65 
 
 		 788 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0851  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 1267 aa  74.7  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.444099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3272  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.28 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3792  pseudomonalisin  26.28 
 
 		 611 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.266774  normal  0.382747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3376  Peptidase S53 propeptide  27.86 
 
 		 545 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206514  normal  0.429578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2635  serine protease, kumamolysin  27.11 
 
 		 553 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.250819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4475  pseudomonalisin  26.28 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3891  pseudomonalisin  26.28 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3636  pseudomonalisin  26.28 
 
 		 610 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0352  Peptidase S53 propeptide  26.75 
 
 		 910 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.065042 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0646  serine protease  36.08 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.23311  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1071  Peptidase S53 propeptide  30.77 
 
 		 507 aa  70.5  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0139548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5281  Peptidase S53 propeptide  27.29 
 
 		 976 aa  70.1  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01452  peptidase  31.14 
 
 		 523 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450693  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0811  sedolisin  35.57 
 
 		 582 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5106  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.57 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.814662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2199  pseudomonalisin  26.07 
 
 		 610 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2497  sedolisin  35.57 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.458922  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2358  sedolisin  35.57 
 
 		 562 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0759  Peptidase S53 propeptide  26.3 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0323007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5054  peptidase S53 propeptide  26.73 
 
 		 519 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.813199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8798  Peptidase S53 propeptide  24.78 
 
 		 610 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.424248  normal  0.572713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4778  Peptidase S53 propeptide  28.87 
 
 		 519 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0280801  hitchhiker  0.00223617 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0002  protease-like protein  25.42 
 
 		 781 aa  63.9  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1994  kumamolisin  27.55 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0343845 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4660  peptidase S53 propeptide  32.49 
 
 		 579 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2438  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 		 1251 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.374669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2044  serine protease  27.06 
 
 		 694 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000458004  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1461  cell wall binding repeat 2-containing protein  30 
 
 		 1073 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0777  peptidase S53 propeptide  28.53 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2163  sedolisin  31 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  26.77 
 
 		 1207 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8631  Peptidase S53 propeptide  29.52 
 
 		 648 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00652442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6936  peptidase S53 propeptide  28.2 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3301  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.57 
 
 		 579 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.479146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3924  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>