80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0108 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  100 
 
 		 445 aa  907    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  39.36 
 
 		 1762 aa  176  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  39.1 
 
 		 1557 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  33.67 
 
 		 312 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  37.7 
 
 		 776 aa  146  6e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 		 586 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  31.19 
 
 		 341 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  28.73 
 
 		 642 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  28.43 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  28.33 
 
 		 321 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  31.72 
 
 		 812 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  27.21 
 
 		 314 aa  114  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  28.74 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  29.46 
 
 		 990 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  25.96 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.17 
 
 		 321 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  30.74 
 
 		 2942 aa  109  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  30.55 
 
 		 339 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  32.3 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  29.21 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  30.07 
 
 		 1656 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  30.3 
 
 		 646 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  30.93 
 
 		 795 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  31.58 
 
 		 430 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  26.07 
 
 		 717 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  23.9 
 
 		 508 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  34.58 
 
 		 346 aa  99.8  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  26.32 
 
 		 471 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  25.89 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  30.53 
 
 		 693 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  26.57 
 
 		 993 aa  90.1  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  32.5 
 
 		 236 aa  86.7  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  24.76 
 
 		 366 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.72 
 
 		 1451 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  24.25 
 
 		 1017 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  25.57 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  27.07 
 
 		 1009 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  27.07 
 
 		 1009 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  25.53 
 
 		 605 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  29.05 
 
 		 180 aa  79.3  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  26.56 
 
 		 448 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  28.05 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  27.05 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1407 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  26.27 
 
 		 396 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.2 
 
 		 1453 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  26.56 
 
 		 336 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  24.73 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.66 
 
 		 1514 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.78 
 
 		 497 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  27.78 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.62 
 
 		 1461 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  27.36 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  26.89 
 
 		 725 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  30.6 
 
 		 483 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  24.91 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  23.76 
 
 		 1245 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  24.68 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  21.13 
 
 		 698 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  21.53 
 
 		 1744 aa  53.1  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  27.73 
 
 		 595 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.85 
 
 		 1215 aa  52  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 514 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2670  Ig-like, group 2  24.83 
 
 		 924 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  27.27 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  32.99 
 
 		 638 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  24.66 
 
 		 154 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  23.78 
 
 		 639 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  25.16 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  24.14 
 
 		 465 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  27.08 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  21.59 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  24.14 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  30.69 
 
 		 970 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  27.03 
 
 		 1474 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>