100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0230 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  687    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  36.88 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  37.19 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  36.52 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  34.81 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  33.11 
 
 		 344 aa  146  5e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  32.09 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  31.16 
 
 		 1762 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  30.82 
 
 		 334 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  30 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  34.07 
 
 		 1017 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  33.7 
 
 		 1009 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  33.7 
 
 		 1009 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  29.54 
 
 		 373 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  31.12 
 
 		 993 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  28.57 
 
 		 445 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  30.07 
 
 		 990 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  35.21 
 
 		 1557 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.76 
 
 		 776 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  32.05 
 
 		 642 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  26.8 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  32.39 
 
 		 471 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  28.81 
 
 		 1656 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  26.07 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  28.1 
 
 		 795 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 586 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.15 
 
 		 812 aa  89.7  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  28.51 
 
 		 2942 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  29.39 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  31.49 
 
 		 180 aa  82.4  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  27 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1407 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  27.43 
 
 		 717 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  23.05 
 
 		 725 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  26.67 
 
 		 588 aa  74.3  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  30.13 
 
 		 1514 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  27.76 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  28.24 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  28.36 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  26.23 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.31 
 
 		 639 aa  70.9  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  28.74 
 
 		 346 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.32 
 
 		 1453 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  34.23 
 
 		 693 aa  68.9  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  27.03 
 
 		 605 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 1451 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  27.21 
 
 		 646 aa  67  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  25.66 
 
 		 508 aa  66.2  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  26.03 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  30.87 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  23.78 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  23.4 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  28.63 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  25.91 
 
 		 698 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  24.46 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  26.94 
 
 		 1461 aa  59.7  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  28.24 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  31.71 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  28.03 
 
 		 1556 aa  58.5  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49881  predicted protein  25.2 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  29.46 
 
 		 383 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  25.27 
 
 		 484 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.84 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.84 
 
 		 392 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  24.84 
 
 		 392 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  27.68 
 
 		 336 aa  54.3  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3966  kelch domain-containing protein  22.76 
 
 		 402 aa  53.5  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.422532  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  26.25 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0984  kelch repeat-containing protein  29.71 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.998088  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  23.15 
 
 		 833 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1887  Kelch repeat-containing protein  25.52 
 
 		 358 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.445604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  29.71 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.97 
 
 		 514 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  27.06 
 
 		 1474 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  24.71 
 
 		 1245 aa  49.3  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  23.66 
 
 		 850 aa  48.9  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0493  kelch repeat-containing protein  22.04 
 
 		 376 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  27.59 
 
 		 382 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0451  kelch repeat-containing protein  25.88 
 
 		 418 aa  48.5  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01192  kelch motif domain protein  25.19 
 
 		 401 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187168  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  32.67 
 
 		 1222 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9490  predicted protein  23.49 
 
 		 506 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  33.33 
 
 		 947 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 909 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42836  predicted protein  23.04 
 
 		 347 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_2897  predicted protein  27.27 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000438685  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 1215 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52303  protein involved in cell fusion and morphogenesis  27.78 
 
 		 970 aa  42.7  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.248654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  30.53 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_23798  predicted protein  28.12 
 
 		 710 aa  42.7  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  20.6 
 
 		 460 aa  42.4  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>