88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2779 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 334 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  36.09 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  31.33 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1762 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1741  kelch repeat-containing protein  28.88 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.571519  normal  0.867228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  28.48 
 
 		 341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  31.69 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  30.82 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  25.96 
 
 		 445 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  30.12 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  30.63 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.86 
 
 		 776 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.35 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1076  protein kinase  30.38 
 
 		 993 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  35.68 
 
 		 812 aa  95.5  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  29.5 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  26.71 
 
 		 990 aa  91.7  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 454 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 471 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  30.51 
 
 		 1017 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  27.2 
 
 		 795 aa  90.5  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  30.51 
 
 		 1009 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 1009 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  26.63 
 
 		 1656 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  27.87 
 
 		 1407 aa  86.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 461 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  32.95 
 
 		 1557 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2569  transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 508 aa  84  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  26.94 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  26.1 
 
 		 2942 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3426  Kelch repeat-containing protein  30.8 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.261709  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2665  glycosy hydrolase family protein  26.9 
 
 		 693 aa  77.8  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.472135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.16 
 
 		 1453 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6725  Kelch repeat-containing protein  28.28 
 
 		 698 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0822  kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 497 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.803957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4361  kelch repeat-containing protein  29.41 
 
 		 717 aa  75.1  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.423968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0506  Kelch repeat-containing protein  28.51 
 
 		 430 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.04 
 
 		 1451 aa  69.3  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1514 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  25.42 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  27.72 
 
 		 1461 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  29.45 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  27.66 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  28.34 
 
 		 646 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  24.12 
 
 		 642 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  23.47 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  32.33 
 
 		 483 aa  59.7  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0037  Kelch repeat-containing protein  28 
 
 		 346 aa  58.9  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0861801  normal  0.239294 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  26.16 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  32.04 
 
 		 382 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0568  kelch repeat-containing protein  37.14 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.558625  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32404  predicted protein  25.48 
 
 		 494 aa  57  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  23.4 
 
 		 588 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  27.41 
 
 		 725 aa  54.3  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  23.53 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  30.81 
 
 		 450 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42834  predicted protein  27.23 
 
 		 639 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03800  conjugation with cellular fusion-related protein, putative  25.41 
 
 		 465 aa  53.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2580  Kelch repeat-containing protein  29 
 
 		 557 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  26.6 
 
 		 1744 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  28.67 
 
 		 327 aa  52.8  0.000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  28.19 
 
 		 1556 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29677  predicted protein  30.87 
 
 		 536 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000968434 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27233  predicted protein  30.87 
 
 		 536 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  28.47 
 
 		 595 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94478  predicted protein  22.53 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0486336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0752  kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 368 aa  51.2  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32786  predicted protein  28.02 
 
 		 660 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2941  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.47 
 
 		 1215 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.972596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1841  Kelch repeat-containing protein  25.68 
 
 		 339 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.958191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  30.43 
 
 		 514 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1613  Kelch repeat-containing protein  25.53 
 
 		 280 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.999489 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04564  Kelch-domain proteinPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q703G6]  30.77 
 
 		 1474 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0386  kelch repeat-containing protein  27.91 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1683  kelch repeat-containing protein  24.88 
 
 		 335 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  27.5 
 
 		 577 aa  47.4  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  28.06 
 
 		 484 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  24.54 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1953  kelch repeat-containing protein  23.49 
 
 		 460 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08430  Kelch repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_5G12780)  28.57 
 
 		 337 aa  46.2  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.820047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  25.52 
 
 		 1245 aa  45.4  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15262  predicted protein  26.46 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  29.44 
 
 		 448 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  24.29 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  31.13 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  28.5 
 
 		 883 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  25 
 
 		 833 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42978  predicted protein  23.81 
 
 		 632 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>