88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2125 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1832  Kelch repeat protein  97.99 
 
 
448 aa  749    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0801627  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1750  Kelch repeat-containing protein  88.89 
 
 
450 aa  695    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0242608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2125  kelch repeat-containing protein  100 
 
 
484 aa  926    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0602938  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5187  hypothetical protein  43.1 
 
 
646 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.300235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  41.49 
 
 
642 aa  160  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4136  kelch repeat-containing protein  36.1 
 
 
605 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378672  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2436  kelch repeat-containing protein  38.7 
 
 
377 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.187004  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2642  kelch repeat-containing protein  42.11 
 
 
366 aa  158  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105005  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3595  kelch domain-containing protein  36.65 
 
 
833 aa  154  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.066444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  37.23 
 
 
586 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  34.12 
 
 
1245 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0447  kelch  39.13 
 
 
382 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.84708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1811  kelch repeat-containing protein  31.25 
 
 
1744 aa  96.7  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.524443  normal  0.65479 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1457  kelch repeat-containing protein  35.52 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0108  Kelch repeat protein  26.56 
 
 
445 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000075462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2528  kelch repeat-containing protein  36.87 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  29.44 
 
 
1762 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2527  kelch repeat-containing protein  35.04 
 
 
154 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  23.88 
 
 
918 aa  67  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1426  Galactose oxidase  27.6 
 
 
593 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1666  kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1597  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.68 
 
 
858 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1572  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  27.97 
 
 
858 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1758  lectin repeat-containing protein  27.68 
 
 
807 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0548  Kelch repeat-containing protein  33.01 
 
 
317 aa  63.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1370  Galactose oxidase  29.94 
 
 
781 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.917148 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1368  galactose oxidase-related protein  27.12 
 
 
858 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0445018  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0847  galactose oxidase-related protein  27.12 
 
 
805 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1210  galactose oxidase  29.94 
 
 
781 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.24163 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0650  galactose oxidase-related protein  27.12 
 
 
800 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.173202  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0506  galactose oxidase-related protein  27.12 
 
 
800 aa  62  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0657  Kelch repeat-containing protein  29.19 
 
 
312 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.951134  normal  0.331381 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  24.83 
 
 
1222 aa  60.8  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1133  kelch repeat-containing protein  27.27 
 
 
341 aa  58.9  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0981995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  28.62 
 
 
919 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  29.08 
 
 
812 aa  58.2  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0230  hypothetical protein  28.28 
 
 
339 aa  57.8  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0169  kelch repeat-containing protein  31.87 
 
 
483 aa  56.6  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  24.14 
 
 
488 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  25.52 
 
 
806 aa  54.7  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0474  response regulator receiver protein  31.14 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.40168  normal  0.0487434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0145  LuxR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
454 aa  54.7  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0574  kelch repeat-containing protein  29.07 
 
 
321 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  31.5 
 
 
1567 aa  53.9  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4434  protein kinase  29.39 
 
 
1009 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0964194  normal  0.216448 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4348  serine/threonine protein kinase  29.39 
 
 
1009 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.875806  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4728  protein kinase  29.39 
 
 
1017 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423258  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  25.17 
 
 
806 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3052  YD repeat-containing protein  24.07 
 
 
2942 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2488  hypothetical protein  31.25 
 
 
433 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4451  Kelch repeat-containing protein  26.24 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0538307  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2524  hypothetical protein  36.57 
 
 
667 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2166  galactose oxidase-like protein  30.72 
 
 
759 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.491286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0730  lectin repeat-containing protein  22.55 
 
 
806 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3906  hypothetical protein  24.69 
 
 
671 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.555541  normal  0.153375 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
954 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1844  metallophosphoesterase  33.63 
 
 
776 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.213592  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  24.92 
 
 
910 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3342  LuxR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
461 aa  48.5  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.7323  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27916  predicted protein  26.34 
 
 
577 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0545063 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0483  hypothetical protein  30.16 
 
 
831 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.003873 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  26.41 
 
 
334 aa  48.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0178297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2029  kelch repeat-containing protein  27.92 
 
 
514 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_6820  predicted protein  28.35 
 
 
236 aa  46.2  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.148371  hitchhiker  0.00500772 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  24.44 
 
 
1557 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7196  hypothetical protein  26.86 
 
 
517 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594351  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7153  predicted protein  24.53 
 
 
180 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.788569  normal  0.191003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.64 
 
 
675 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2977  hypothetical protein  23.09 
 
 
652 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4892  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0109077  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4720  hypothetical protein  37.5 
 
 
473 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.566617 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0556  kelch repeat-containing protein  24.57 
 
 
909 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.267215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2327  Galactose oxidase  26.26 
 
 
638 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0584  Kelch repeat-containing protein  28.89 
 
 
321 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3142  hypothetical protein  23.09 
 
 
652 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0379  kelch domain-containing protein  24.57 
 
 
947 aa  45.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32786  predicted protein  28.92 
 
 
660 aa  44.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  26.4 
 
 
1461 aa  44.3  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0935  kelch repeat-containing protein  27.4 
 
 
990 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.35348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2812  kelch repeat-containing protein  27.1 
 
 
795 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.743776  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02740  conserved hypothetical protein  26.32 
 
 
1556 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03470  expressed protein  36.84 
 
 
1146 aa  43.9  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2899  Kelch repeat-containing protein  26.29 
 
 
321 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>