30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3569 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  100 
 
 		 356 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  37.6 
 
 		 353 aa  207  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1425  Kelch repeat-containing protein  32.34 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.3472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  31.12 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.38 
 
 		 883 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  26.79 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  25 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 850 aa  99.8  7e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  27.46 
 
 		 384 aa  89.7  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  25.28 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2044  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.69 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.0393599 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2362  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.69 
 
 		 392 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00527455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2260  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.69 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4835  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.56 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4909  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.39 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04177  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.691491  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3688  Kelch repeat-containing protein  26.56 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04139  hypothetical protein  26.56 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4535  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.56 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0287347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  25 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5814  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.14 
 
 		 368 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1195  N-acetylneuraminic acid mutarotase  38.53 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  38.89 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  41.3 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  40.86 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1372  N-acetylneuraminic acid mutarotase  27.98 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1371  hypothetical protein  24.79 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0355  N-acetylneuraminic acid mutarotase  34.31 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1762 aa  49.3  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2779  kelch repeat-containing protein  24.29 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0178297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>