More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3022 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 883 aa  1800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.34 
 
 		 892 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3255  Kelch repeat-containing protein  44.47 
 
 		 383 aa  301  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0696551 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  35.56 
 
 		 509 aa  273  1e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  36.25 
 
 		 498 aa  266  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  36.25 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  36.25 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  36.25 
 
 		 498 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  34.64 
 
 		 529 aa  251  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  33.2 
 
 		 570 aa  248  4.9999999999999997e-64  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.71 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.71 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  33.33 
 
 		 527 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.96 
 
 		 542 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  33.18 
 
 		 527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  31.67 
 
 		 522 aa  231  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  34.2 
 
 		 505 aa  231  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  33.73 
 
 		 505 aa  227  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2624  Kelch repeat-containing protein  33.33 
 
 		 372 aa  219  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0288564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  31.4 
 
 		 520 aa  184  7e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2065  Kelch repeat-containing protein  32.3 
 
 		 418 aa  172  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000118858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.91 
 
 		 479 aa  171  5e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 530 aa  170  9e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.88 
 
 		 526 aa  168  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  28.42 
 
 		 489 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  31.14 
 
 		 501 aa  163  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  31.44 
 
 		 468 aa  162  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  28.54 
 
 		 513 aa  160  9e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2212  Kelch repeat-containing protein  30.65 
 
 		 353 aa  157  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.556252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  29.67 
 
 		 513 aa  155  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.49 
 
 		 581 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  31.43 
 
 		 468 aa  154  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  30.99 
 
 		 472 aa  154  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  30.45 
 
 		 472 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  32.14 
 
 		 470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  32.16 
 
 		 547 aa  147  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30 
 
 		 574 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  31.61 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  28.63 
 
 		 533 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  28.78 
 
 		 467 aa  134  6e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.25 
 
 		 509 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  29.89 
 
 		 562 aa  131  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3569  Kelch repeat-containing protein  31.38 
 
 		 356 aa  131  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.14422 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.49 
 
 		 526 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  31.37 
 
 		 581 aa  129  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.96 
 
 		 523 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  33.33 
 
 		 566 aa  127  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  25.2 
 
 		 551 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 		 566 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  30.86 
 
 		 568 aa  125  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.98 
 
 		 523 aa  125  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.26 
 
 		 523 aa  125  5e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  30.28 
 
 		 517 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.06 
 
 		 592 aa  124  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.94 
 
 		 565 aa  123  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.4 
 
 		 548 aa  121  4.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0722  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 384 aa  121  6e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.309289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.12 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2467  cyclically-permuted mutatrotase family protein  27.37 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000354773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  28.23 
 
 		 520 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.99 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.06 
 
 		 551 aa  117  7.999999999999999e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.72 
 
 		 533 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.66 
 
 		 520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.67 
 
 		 519 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  30 
 
 		 502 aa  115  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  28.74 
 
 		 509 aa  114  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.32 
 
 		 520 aa  114  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.75 
 
 		 557 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  27.48 
 
 		 565 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.54 
 
 		 557 aa  110  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.9 
 
 		 522 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  25.79 
 
 		 545 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.71 
 
 		 520 aa  107  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.98 
 
 		 522 aa  107  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.41 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.02 
 
 		 522 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1514  kelch repeat-containing protein  25.95 
 
 		 384 aa  106  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  28.61 
 
 		 597 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.67 
 
 		 562 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  23.53 
 
 		 569 aa  102  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.8 
 
 		 539 aa  99  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.37 
 
 		 596 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  25.43 
 
 		 549 aa  98.6  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  22.25 
 
 		 486 aa  98.2  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  22.82 
 
 		 487 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.86 
 
 		 567 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.65 
 
 		 537 aa  96.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 562 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.5 
 
 		 518 aa  95.9  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.38 
 
 		 565 aa  95.5  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.66 
 
 		 526 aa  94.4  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1240  N-acetylneuraminic acid mutarotase  26.38 
 
 		 380 aa  94.4  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.187343  normal  0.36338 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.17 
 
 		 550 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 568 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 850 aa  93.6  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 590 aa  93.2  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1205  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.98 
 
 		 384 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.9636  normal  0.260259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1225  N-acetylneuraminic acid mutarotase  25.59 
 
 		 386 aa  91.7  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.293082  normal  0.60575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.27 
 
 		 613 aa  91.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>