More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04816 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  77.78 
 
 		 513 aa  822    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  100 
 
 		 513 aa  1030    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  39.33 
 
 		 581 aa  342  1e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.97 
 
 		 542 aa  251  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.35 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.5 
 
 		 892 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.63 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.91 
 
 		 479 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  29.47 
 
 		 522 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  28.41 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 883 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  26.2 
 
 		 520 aa  154  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  26.9 
 
 		 501 aa  154  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.79 
 
 		 526 aa  152  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  33.7 
 
 		 547 aa  151  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  29.33 
 
 		 509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  29.69 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.28 
 
 		 526 aa  147  5e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  27.47 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 533 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 		 527 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.1 
 
 		 527 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  27.37 
 
 		 505 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  25.94 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.37 
 
 		 505 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  28.02 
 
 		 598 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  26.36 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30 
 
 		 574 aa  137  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  29.64 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.62 
 
 		 523 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  25.81 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  25.29 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  30.92 
 
 		 562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.09 
 
 		 548 aa  134  3.9999999999999996e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 		 537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.4 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.4 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 489 aa  133  6.999999999999999e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 551 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  29.3 
 
 		 581 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.82 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  30.51 
 
 		 566 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.84 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  27.06 
 
 		 520 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.2 
 
 		 565 aa  128  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.73 
 
 		 592 aa  127  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.8 
 
 		 520 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.8 
 
 		 520 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  27.83 
 
 		 568 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.92 
 
 		 520 aa  123  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.74 
 
 		 498 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  27.74 
 
 		 498 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  26.21 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  29.41 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 502 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.17 
 
 		 509 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  24.4 
 
 		 545 aa  120  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 		 533 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.5 
 
 		 562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.19 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.57 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  26.86 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.94 
 
 		 597 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.37 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.83 
 
 		 613 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.31 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.25 
 
 		 550 aa  111  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.64 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  25.94 
 
 		 531 aa  109  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  23.46 
 
 		 487 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  22.46 
 
 		 565 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.17 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.87 
 
 		 562 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  25.11 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  27.98 
 
 		 570 aa  107  5e-22  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 565 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 		 570 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  25.27 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  23.48 
 
 		 551 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.16 
 
 		 557 aa  103  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  23.91 
 
 		 539 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  24.62 
 
 		 532 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  29.71 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  26.51 
 
 		 557 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0273  sodium/proline symporter  25.88 
 
 		 504 aa  100  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  23.4 
 
 		 492 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  23.11 
 
 		 560 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  22.81 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  23.97 
 
 		 551 aa  98.6  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  24.67 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.71 
 
 		 549 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  27.35 
 
 		 562 aa  97.1  6e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26 
 
 		 482 aa  97.1  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  24.26 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  24.56 
 
 		 509 aa  96.7  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  24.35 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  23.95 
 
 		 571 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>