295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5643 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  100 
 
 
532 aa  1065    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  39.51 
 
 
571 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  39.51 
 
 
571 aa  404  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  39.51 
 
 
571 aa  405  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  39.32 
 
 
571 aa  404  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  39.51 
 
 
571 aa  404  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  39.32 
 
 
571 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  39.23 
 
 
562 aa  384  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  37.96 
 
 
551 aa  384  1e-105  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  40.68 
 
 
529 aa  376  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  39.25 
 
 
531 aa  364  2e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  33.52 
 
 
530 aa  293  7e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.3 
 
 
474 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.39 
 
 
473 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.43 
 
 
474 aa  240  5e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  30.88 
 
 
509 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  29.9 
 
 
520 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.71 
 
 
523 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.47 
 
 
592 aa  191  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.05 
 
 
522 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.85 
 
 
486 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.99 
 
 
520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.99 
 
 
522 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.2 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.38 
 
 
519 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.26 
 
 
520 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.44 
 
 
522 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30 
 
 
561 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.91 
 
 
520 aa  176  9e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1893  Na+/myo-inositol cotransporter  39.57 
 
 
234 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0549999  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  28.41 
 
 
562 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  29.84 
 
 
486 aa  169  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.21 
 
 
526 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  26.61 
 
 
539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.49 
 
 
565 aa  167  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  29.06 
 
 
545 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.38 
 
 
533 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  28.76 
 
 
557 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  28.45 
 
 
557 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  25.77 
 
 
568 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.75 
 
 
549 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.05 
 
 
548 aa  154  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  27.69 
 
 
565 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 
523 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  29.28 
 
 
561 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.54 
 
 
522 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  29.21 
 
 
536 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.14 
 
 
561 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.83 
 
 
551 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 
765 aa  117  5e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  25.33 
 
 
598 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  24.6 
 
 
529 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.78 
 
 
526 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  27.15 
 
 
596 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.78 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.78 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.62 
 
 
513 aa  98.6  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.81 
 
 
537 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  25.76 
 
 
564 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.33 
 
 
569 aa  93.6  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.42 
 
 
513 aa  92.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.37 
 
 
613 aa  89.7  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  23.33 
 
 
489 aa  86.7  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 
530 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  27.3 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  25.78 
 
 
566 aa  82.8  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.22 
 
 
526 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  20.94 
 
 
581 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.71 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.46 
 
 
565 aa  79.3  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  22.91 
 
 
509 aa  79  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  21.3 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  24.39 
 
 
562 aa  77.4  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.32 
 
 
562 aa  77  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.64 
 
 
550 aa  77  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  25.22 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.13 
 
 
593 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  26.87 
 
 
483 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.3 
 
 
574 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  23.65 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  23.3 
 
 
568 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  23.8 
 
 
883 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.14 
 
 
485 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
492 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  20.66 
 
 
604 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  23.17 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.24 
 
 
526 aa  68.6  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  25.59 
 
 
483 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.64 
 
 
597 aa  67.4  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  23.96 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.79 
 
 
484 aa  67  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.54 
 
 
492 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  24.72 
 
 
488 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  24.27 
 
 
581 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  27.27 
 
 
547 aa  64.7  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  22.54 
 
 
467 aa  64.3  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  27 
 
 
483 aa  64.3  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.16 
 
 
492 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.286578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>