More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1380 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  56.15 
 
 		 565 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 562 aa  1138    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  58.9 
 
 		 568 aa  685    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  61.03 
 
 		 581 aa  699    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  59.18 
 
 		 566 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.18 
 
 		 574 aa  575  1.0000000000000001e-163  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  50.82 
 
 		 547 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  45.92 
 
 		 566 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.97 
 
 		 542 aa  223  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  30 
 
 		 530 aa  161  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.51 
 
 		 479 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  35.22 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.45 
 
 		 526 aa  154  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 		 527 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  30.1 
 
 		 581 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  26.61 
 
 		 529 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  32.1 
 
 		 520 aa  150  9e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  30.18 
 
 		 513 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  30.92 
 
 		 513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  30 
 
 		 533 aa  134  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  24.84 
 
 		 527 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 522 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  28.43 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  29.89 
 
 		 883 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  27.39 
 
 		 526 aa  123  7e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.81 
 
 		 473 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  26.32 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.94 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  28.05 
 
 		 467 aa  116  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  27.76 
 
 		 472 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  27.52 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  28.57 
 
 		 501 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  29.32 
 
 		 489 aa  113  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 509 aa  111  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.24 
 
 		 892 aa  109  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.62 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.62 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  27.94 
 
 		 517 aa  109  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  28.97 
 
 		 502 aa  106  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.66 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  26.97 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  26.06 
 
 		 486 aa  103  8e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.74 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.52 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.52 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.52 
 
 		 498 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  28.52 
 
 		 498 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  27.36 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  26.4 
 
 		 505 aa  99  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.23 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.57 
 
 		 519 aa  97.8  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.09 
 
 		 505 aa  97.4  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  26.89 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.34 
 
 		 522 aa  96.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  24.83 
 
 		 487 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.93 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.39 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 509 aa  94  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  24.76 
 
 		 545 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.76 
 
 		 520 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  21.94 
 
 		 765 aa  91.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.08 
 
 		 562 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.01 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.5 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  26.49 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 488 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.24 
 
 		 561 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.49 
 
 		 561 aa  87  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  24.38 
 
 		 492 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.41 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  21.85 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.32 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  24.84 
 
 		 568 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.13 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  23.3 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.42 
 
 		 548 aa  82.8  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.05 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  27.5 
 
 		 597 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  24.76 
 
 		 529 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.13 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  24.68 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07575  putative transmembrane sodium-solute transporter  23.05 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  25.41 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  25.41 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  25.41 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  25.41 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.2 
 
 		 557 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  26.13 
 
 		 501 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  25.41 
 
 		 571 aa  78.2  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.18 
 
 		 575 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  25.4 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  25.41 
 
 		 571 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.65 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  20.98 
 
 		 565 aa  76.6  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  24.06 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.4 
 
 		 613 aa  74.3  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  31.27 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  24.14 
 
 		 539 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>