More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1518 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 892 aa  1808    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.34 
 
 		 883 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  39.19 
 
 		 498 aa  299  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  39.19 
 
 		 498 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  39.19 
 
 		 498 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  39.19 
 
 		 498 aa  298  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.32 
 
 		 510 aa  284  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.32 
 
 		 510 aa  284  6.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  37.61 
 
 		 509 aa  279  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  35.62 
 
 		 570 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  34.95 
 
 		 529 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  31.08 
 
 		 505 aa  255  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  31.25 
 
 		 505 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  34.88 
 
 		 527 aa  251  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  32.5 
 
 		 527 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.11 
 
 		 542 aa  234  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  30.66 
 
 		 522 aa  232  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.73 
 
 		 479 aa  180  8e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 520 aa  174  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  28.39 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  32.11 
 
 		 468 aa  164  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  29.5 
 
 		 513 aa  162  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  29.61 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.95 
 
 		 526 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  30.34 
 
 		 472 aa  154  8.999999999999999e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  29.86 
 
 		 472 aa  154  8.999999999999999e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  28.66 
 
 		 513 aa  154  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  28.77 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  30.28 
 
 		 501 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  27.78 
 
 		 468 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  30.14 
 
 		 467 aa  147  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 526 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  28.57 
 
 		 523 aa  142  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 470 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  29.94 
 
 		 473 aa  140  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  24.54 
 
 		 489 aa  126  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.65 
 
 		 533 aa  125  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  28.54 
 
 		 523 aa  124  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.39 
 
 		 551 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  25.24 
 
 		 562 aa  120  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  26.09 
 
 		 566 aa  120  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  28.07 
 
 		 547 aa  117  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  26.19 
 
 		 509 aa  113  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.62 
 
 		 574 aa  114  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  27.95 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.71 
 
 		 522 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  26.22 
 
 		 488 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.8 
 
 		 548 aa  111  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.11 
 
 		 526 aa  111  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.25 
 
 		 520 aa  110  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 502 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.69 
 
 		 523 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.76 
 
 		 483 aa  108  5e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  27.78 
 
 		 566 aa  106  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.14 
 
 		 598 aa  105  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  24.09 
 
 		 487 aa  104  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  25.87 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.3 
 
 		 557 aa  103  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.5 
 
 		 522 aa  103  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  28.33 
 
 		 509 aa  102  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.19 
 
 		 556 aa  101  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  25.39 
 
 		 565 aa  101  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.73 
 
 		 520 aa  101  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  22.31 
 
 		 597 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  24.83 
 
 		 581 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.03 
 
 		 592 aa  100  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  23.9 
 
 		 486 aa  99.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  23.73 
 
 		 520 aa  100  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  26.23 
 
 		 517 aa  98.2  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  22.17 
 
 		 590 aa  96.3  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.46 
 
 		 522 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.56 
 
 		 537 aa  95.9  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.66 
 
 		 596 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.52 
 
 		 519 aa  95.5  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.47 
 
 		 565 aa  94.4  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  23.86 
 
 		 520 aa  94  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  26.09 
 
 		 492 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.53 
 
 		 567 aa  92.8  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.94 
 
 		 520 aa  92.8  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.53 
 
 		 593 aa  91.7  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 596 aa  90.5  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  25.43 
 
 		 562 aa  90.1  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  24.9 
 
 		 596 aa  88.2  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.32 
 
 		 570 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  25.17 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54150  sodium/proline symporter PutP  24.69 
 
 		 506 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.85 
 
 		 518 aa  84.7  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4736  sodium/proline symporter PutP  24.49 
 
 		 506 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.865445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.11 
 
 		 561 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.41 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  25.37 
 
 		 575 aa  82.4  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  21.81 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.7 
 
 		 517 aa  80.5  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  22.88 
 
 		 562 aa  80.1  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  24.2 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  24.02 
 
 		 493 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1081  sodium/proline symporter  25.77 
 
 		 498 aa  79.3  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000772394  unclonable  0.00000000000701401 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.85 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6812  Na+/solute symporter  22.78 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641673  hitchhiker  0.00114247 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>