More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0525 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 522 aa  1036    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  33.62 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  33.33 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  31.05 
 
 		 529 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.66 
 
 		 892 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  30.2 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  30.2 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  30.2 
 
 		 498 aa  227  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  30.2 
 
 		 498 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  31.67 
 
 		 883 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.74 
 
 		 542 aa  219  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  27.31 
 
 		 509 aa  200  6e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  30.41 
 
 		 520 aa  189  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  27.84 
 
 		 505 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  27.84 
 
 		 505 aa  180  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  28.41 
 
 		 570 aa  178  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.33 
 
 		 479 aa  174  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.79 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.79 
 
 		 510 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  30.04 
 
 		 530 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.18 
 
 		 489 aa  158  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  29.47 
 
 		 513 aa  152  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  28.54 
 
 		 513 aa  150  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  27.22 
 
 		 526 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  27.82 
 
 		 468 aa  148  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  27.57 
 
 		 581 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  29.41 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  28.09 
 
 		 472 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.43 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  26.42 
 
 		 533 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  26.69 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  29.86 
 
 		 523 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.88 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  27.96 
 
 		 470 aa  133  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.45 
 
 		 523 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  29.21 
 
 		 517 aa  130  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  28.96 
 
 		 473 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.3 
 
 		 574 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 562 aa  127  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  26.63 
 
 		 598 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  29 
 
 		 568 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  29.32 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.4 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  28 
 
 		 467 aa  121  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 		 520 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.29 
 
 		 548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.78 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  25.94 
 
 		 547 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  27.25 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.07 
 
 		 565 aa  113  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  27.6 
 
 		 502 aa  112  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.23 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.23 
 
 		 520 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.79 
 
 		 519 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  25.28 
 
 		 520 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  25.43 
 
 		 568 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.36 
 
 		 523 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 537 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  26.84 
 
 		 581 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.47 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  24.21 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.25 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.11 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  25.75 
 
 		 545 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  26.79 
 
 		 539 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.52 
 
 		 522 aa  103  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.17 
 
 		 597 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  22.6 
 
 		 564 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  26.27 
 
 		 565 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  24.45 
 
 		 536 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  25.7 
 
 		 549 aa  96.3  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1598  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 487 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.414751 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.18 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.3 
 
 		 569 aa  95.1  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  24.92 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.74 
 
 		 551 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.03 
 
 		 533 aa  94  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  26.77 
 
 		 561 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 		 526 aa  93.2  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  22.81 
 
 		 486 aa  92  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  24.69 
 
 		 509 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  25.48 
 
 		 561 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  25.82 
 
 		 587 aa  91.3  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2903  Na+/solute symporter  23.18 
 
 		 488 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.585746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  21.48 
 
 		 590 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.26 
 
 		 556 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 570 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.52 
 
 		 575 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.07 
 
 		 551 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.29 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.82 
 
 		 482 aa  84.3  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.23 
 
 		 609 aa  84.3  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  21.43 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.77 
 
 		 567 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.65 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  22.81 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>