More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0961 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  78.53 
 
 		 585 aa  932    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  77.38 
 
 		 588 aa  927    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  75.64 
 
 		 587 aa  894    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  100 
 
 		 587 aa  1173    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  79.56 
 
 		 586 aa  954    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  76.83 
 
 		 587 aa  904    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  80.44 
 
 		 588 aa  959    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  51.4 
 
 		 609 aa  521  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  45.87 
 
 		 599 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  42.33 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  36.48 
 
 		 603 aa  356  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  37.2 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  34.94 
 
 		 583 aa  300  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  33.91 
 
 		 583 aa  293  4e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.75 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  32.75 
 
 		 587 aa  268  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  35.57 
 
 		 587 aa  260  5.0000000000000005e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  32.01 
 
 		 589 aa  253  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  29.71 
 
 		 538 aa  180  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.79 
 
 		 596 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  26.96 
 
 		 609 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  27.24 
 
 		 625 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.69 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  25.42 
 
 		 625 aa  140  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  25 
 
 		 596 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  26.17 
 
 		 593 aa  137  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  28.06 
 
 		 597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.29 
 
 		 520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.18 
 
 		 526 aa  110  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  26.88 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 604 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  24.39 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.43 
 
 		 522 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2416  Na+/solute symporter  26.61 
 
 		 575 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.664159  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.93 
 
 		 523 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.24 
 
 		 520 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.82 
 
 		 523 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.55 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  26.04 
 
 		 461 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.74 
 
 		 520 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.33 
 
 		 570 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  23.54 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.85 
 
 		 519 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.91 
 
 		 548 aa  93.6  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  26.14 
 
 		 590 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.48 
 
 		 542 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.82 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.61 
 
 		 522 aa  90.9  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  25.99 
 
 		 551 aa  90.5  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.85 
 
 		 479 aa  90.1  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.91 
 
 		 526 aa  89.4  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2435  sodium/proline symporter  25.29 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.015008  hitchhiker  0.00456377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  23.98 
 
 		 530 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  26.15 
 
 		 476 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.06 
 
 		 533 aa  87.4  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  24.73 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  26.2 
 
 		 483 aa  87.4  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.36 
 
 		 565 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  22.63 
 
 		 537 aa  87  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.85 
 
 		 461 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  23.94 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  24.73 
 
 		 518 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  23.51 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  24.87 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  23.8 
 
 		 590 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  24.84 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.6 
 
 		 522 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.12 
 
 		 505 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.69 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  24.52 
 
 		 505 aa  82  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  23.11 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  22.96 
 
 		 549 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  22.19 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  25.34 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  25.49 
 
 		 487 aa  80.1  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1451  sodium/proline symporter  23.17 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0423407  unclonable  0.000000000084673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.18 
 
 		 509 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.43 
 
 		 551 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6961  Na+/solute symporter  26.41 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.931741  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  23.13 
 
 		 529 aa  77.8  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  22.8 
 
 		 545 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.41 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2469  sodium/proline symporter  23.08 
 
 		 497 aa  77  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00121427  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.87 
 
 		 522 aa  77  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1588  sodium/proline symporter  22.93 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000493204  unclonable  0.00000000000453194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2865  sodium/proline symporter  22.93 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  24.21 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2790  sodium/proline symporter  22.93 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2770  sodium/proline symporter  22.93 
 
 		 483 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000703765  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.68 
 
 		 488 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1520  Sodium/proline symporter  23.25 
 
 		 483 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.82 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  21.71 
 
 		 633 aa  75.1  0.000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  23.66 
 
 		 498 aa  75.1  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 562 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  23.55 
 
 		 598 aa  74.7  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  22.81 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  26.9 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>