More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0638 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  100 
 
 		 538 aa  1066    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  33.71 
 
 		 577 aa  199  7.999999999999999e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  30.26 
 
 		 603 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  29.14 
 
 		 599 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  30.3 
 
 		 588 aa  186  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  31.19 
 
 		 609 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  29.35 
 
 		 586 aa  177  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  29.53 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  29.71 
 
 		 587 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  29.24 
 
 		 585 aa  171  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  29.8 
 
 		 587 aa  163  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  29.19 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  29 
 
 		 587 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.46 
 
 		 593 aa  157  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  30.7 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  30.13 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  30.31 
 
 		 587 aa  146  9e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  28.12 
 
 		 583 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.62 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  27.56 
 
 		 583 aa  143  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  26.39 
 
 		 625 aa  140  7e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.02 
 
 		 609 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  26.55 
 
 		 596 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.29 
 
 		 594 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  30.7 
 
 		 589 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  24.1 
 
 		 625 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.4 
 
 		 523 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  27.85 
 
 		 489 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.04 
 
 		 592 aa  94.4  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.78 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  23.19 
 
 		 476 aa  89.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  23.87 
 
 		 633 aa  89.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.33 
 
 		 520 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  28.53 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  25.33 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.43 
 
 		 527 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.66 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000913  sodium-solute symporter putative  23.5 
 
 		 590 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  24.22 
 
 		 597 aa  84.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.45 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  25.16 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  25.05 
 
 		 487 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.44 
 
 		 485 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  24.04 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.16 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  25.27 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02712  proline/sodium symporter  26.6 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.076903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 482 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.05 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.31 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.23 
 
 		 493 aa  80.1  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  25.76 
 
 		 483 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.67 
 
 		 492 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.9 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 590 aa  79  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 		 492 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  24.7 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  24.7 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.2 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  24.7 
 
 		 492 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.36 
 
 		 472 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.94 
 
 		 519 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.42 
 
 		 548 aa  77.8  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  25.88 
 
 		 492 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  24.5 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.55 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  21.67 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  24.54 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  23.35 
 
 		 604 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.04 
 
 		 492 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  25.82 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.5 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  26.24 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  25.7 
 
 		 488 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 		 492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.59 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  26.98 
 
 		 492 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  26.02 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  26.57 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.32 
 
 		 522 aa  74.3  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.36 
 
 		 567 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  24.49 
 
 		 484 aa  73.9  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.57 
 
 		 533 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  24.18 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.94 
 
 		 551 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  25.04 
 
 		 500 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.3 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  22.94 
 
 		 459 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  23.53 
 
 		 479 aa  72  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1396  Na+/proline symporter  22.39 
 
 		 553 aa  71.6  0.00000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 		 593 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  24.63 
 
 		 549 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.06 
 
 		 513 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>