More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_18811 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  97.77 
 
 
583 aa  1108    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  66.13 
 
 
587 aa  703    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  67.42 
 
 
584 aa  733    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  100 
 
 
583 aa  1150    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  66.49 
 
 
589 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  70.95 
 
 
587 aa  803    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  52.92 
 
 
577 aa  557  1e-157  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  48.97 
 
 
603 aa  545  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  34.72 
 
 
599 aa  333  6e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  36.05 
 
 
575 aa  311  2.9999999999999997e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  33.97 
 
 
587 aa  294  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  33.27 
 
 
586 aa  288  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  36.7 
 
 
609 aa  288  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  33 
 
 
588 aa  283  7.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  34.02 
 
 
587 aa  282  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  32.19 
 
 
585 aa  280  8e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  33.58 
 
 
588 aa  276  7e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  32.02 
 
 
587 aa  265  1e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  27.56 
 
 
538 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  28.68 
 
 
596 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  27.71 
 
 
596 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  24.81 
 
 
625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  26.97 
 
 
625 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  27.79 
 
 
609 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  25.09 
 
 
593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.46 
 
 
597 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  26.82 
 
 
594 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.94 
 
 
529 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.99 
 
 
483 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.54 
 
 
565 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  29.07 
 
 
592 aa  107  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27 
 
 
523 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  26.33 
 
 
551 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  27.63 
 
 
509 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.01 
 
 
533 aa  101  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.66 
 
 
526 aa  101  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  28.16 
 
 
520 aa  99.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.28 
 
 
461 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.62 
 
 
527 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1660  Na+/solute symporter  27.41 
 
 
489 aa  97.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.139174  normal  0.613212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.81 
 
 
520 aa  97.1  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  25.78 
 
 
520 aa  96.3  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.03 
 
 
520 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  27.55 
 
 
520 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.51 
 
 
567 aa  95.1  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.79 
 
 
522 aa  93.6  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.16 
 
 
519 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  23.57 
 
 
556 aa  90.9  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  25.2 
 
 
509 aa  90.5  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  28.53 
 
 
460 aa  90.1  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.67 
 
 
522 aa  90.1  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  27.49 
 
 
461 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  28.69 
 
 
498 aa  89.4  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  23.87 
 
 
527 aa  87.8  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  26.7 
 
 
551 aa  87.4  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  27.49 
 
 
500 aa  87.4  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  25.83 
 
 
484 aa  87  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.06 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0171  sodium/proline symporter  28.81 
 
 
496 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.89 
 
 
526 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  26.85 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  26.99 
 
 
461 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.75 
 
 
537 aa  83.6  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  26.98 
 
 
497 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.16 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2893  Na+/solute symporter  24.86 
 
 
604 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  24.17 
 
 
530 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  25.48 
 
 
485 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  24.82 
 
 
638 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.82 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  23.99 
 
 
492 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.18 
 
 
523 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.68 
 
 
596 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.04 
 
 
518 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27 
 
 
557 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.98 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.71 
 
 
483 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.98 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.98 
 
 
492 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.51 
 
 
562 aa  78.6  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.39 
 
 
491 aa  78.6  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.55 
 
 
482 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  23.84 
 
 
492 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.79 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.79 
 
 
492 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  27.08 
 
 
483 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.3 
 
 
492 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  23.7 
 
 
492 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  24.3 
 
 
492 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  24.89 
 
 
482 aa  76.3  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  22.91 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.08 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  26.53 
 
 
557 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.11 
 
 
548 aa  75.5  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  25.53 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.29 
 
 
542 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  22.54 
 
 
571 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  22.54 
 
 
571 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  23.29 
 
 
479 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  22.54 
 
 
571 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>