274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2441 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2441  Na+/solute symporter  100 
 
 		 625 aa  1263    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231666  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  57.67 
 
 		 596 aa  713    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  56.81 
 
 		 596 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2033  Na+/solute symporter  46.3 
 
 		 625 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  32.27 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0565  Na+/solute symporter  31.37 
 
 		 594 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.426275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  30.83 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  27.37 
 
 		 587 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 586 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  28.25 
 
 		 587 aa  164  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  26.87 
 
 		 603 aa  163  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1178  sodium:solute symporter family protein  26.18 
 
 		 585 aa  160  5e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.107894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  26.14 
 
 		 588 aa  154  4e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0638  Na+/solute symporter  26.41 
 
 		 538 aa  151  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1755  hypothetical protein  25.59 
 
 		 577 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18811  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  24.86 
 
 		 583 aa  145  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0257597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1011  Na+/proline symporter  24.49 
 
 		 583 aa  144  5e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1083  Na+/solute symporter  24.78 
 
 		 588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0991073  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2062  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.41 
 
 		 584 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.039516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1120  Na+/solute symporter  27.59 
 
 		 587 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.13754  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  25 
 
 		 587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2245  Na+/solute symporter  25.6 
 
 		 609 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0610  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  26.4 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.922091  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  21.95 
 
 		 599 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04421  sodium/solute symporter family protein glucose transporter  25.22 
 
 		 589 aa  120  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.41 
 
 		 575 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  24.25 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.73 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.08 
 
 		 542 aa  94  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  24.02 
 
 		 537 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.15 
 
 		 593 aa  87.4  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  23.47 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  23.22 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.63 
 
 		 613 aa  84  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  23.27 
 
 		 549 aa  83.6  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.16 
 
 		 526 aa  83.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.58 
 
 		 548 aa  83.2  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  22.33 
 
 		 633 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  22.33 
 
 		 565 aa  81.6  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  22.34 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.81 
 
 		 567 aa  81.3  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  22.65 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  24.32 
 
 		 506 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.84 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  22.56 
 
 		 539 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.33 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.69 
 
 		 472 aa  75.1  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  23.76 
 
 		 597 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  23.26 
 
 		 639 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  22.05 
 
 		 638 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  24.24 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.51 
 
 		 550 aa  72.4  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.83 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.36 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  21.91 
 
 		 545 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.78 
 
 		 527 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.58 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.32 
 
 		 461 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  30.49 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  20.8 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  26.39 
 
 		 468 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3587  Na+/solute symporter  21.32 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0355  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  25.29 
 
 		 523 aa  67  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  27.87 
 
 		 468 aa  67  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  30.36 
 
 		 492 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  21.44 
 
 		 568 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  23.5 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  23.5 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  23.5 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  24.4 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.02 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  23.5 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  23.5 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  27.75 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  29.88 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0289  Na+/solute symporter  23.25 
 
 		 590 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0322805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  24.01 
 
 		 492 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  23.18 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  22.61 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  23.95 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  23.32 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  21.55 
 
 		 483 aa  62  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0041  sodium/pantothenate symporter  22.1 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.3030600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  24.36 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  22.74 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  21.55 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  23.82 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1716  GTP-binding protein, HSR1-releated protein  22.91 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.066858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05410  Sodium:solute symporter  23.44 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  22.89 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  21.22 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.11 
 
 		 520 aa  60.5  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  23.3 
 
 		 557 aa  60.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  31.3 
 
 		 488 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  24.81 
 
 		 489 aa  60.1  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  22.98 
 
 		 533 aa  60.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  22.2 
 
 		 509 aa  60.5  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  25.06 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>