More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06350 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  100 
 
 
506 aa  1001    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4898  solute/sodium symporter (SSS) family protein  68.97 
 
 
489 aa  642    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0089  Na+/solute symporter  64.41 
 
 
496 aa  620  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000762337  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  29.91 
 
 
460 aa  133  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  29.58 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  28.36 
 
 
461 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  28.26 
 
 
459 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  27.07 
 
 
462 aa  125  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  28.04 
 
 
459 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  28.36 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  27.99 
 
 
459 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  27.98 
 
 
463 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2949  Na+/solute symporter  28.83 
 
 
500 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0128221  hitchhiker  0.000189844 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  25.1 
 
 
483 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  27.77 
 
 
459 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  25.73 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  27.49 
 
 
463 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  23.31 
 
 
472 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  28.63 
 
 
479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  27.41 
 
 
523 aa  113  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  26.86 
 
 
507 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3406  Na+/solute symporter  25.3 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183888  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1620  Na+/solute symporter  27.82 
 
 
460 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0163738 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0309  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2709  Na+/solute symporter  25.81 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  25.38 
 
 
638 aa  111  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0367  Na+/solute symporter  28.1 
 
 
446 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.101074  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0375  Na+/solute symporter  25.6 
 
 
478 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.89 
 
 
523 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  24.84 
 
 
476 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.58 
 
 
484 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0463  sodium/solute symporter transmembrane protein  26.21 
 
 
479 aa  104  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.5 
 
 
598 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  26.86 
 
 
483 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0695  Na+/solute symporter  27.9 
 
 
492 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.921144  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  24.89 
 
 
481 aa  103  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4155  Na+/solute symporter  26.71 
 
 
515 aa  102  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.128874  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  24.4 
 
 
474 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  25.7 
 
 
486 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0436  Na+/solute symporter  24.4 
 
 
478 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 
526 aa  100  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0718  Na+/solute symporter  23.82 
 
 
486 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  25.31 
 
 
492 aa  98.6  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  24.74 
 
 
492 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  26.64 
 
 
496 aa  97.1  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.67 
 
 
533 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  27.67 
 
 
463 aa  97.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.27 
 
 
504 aa  96.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  24.62 
 
 
483 aa  96.7  9e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  26.68 
 
 
592 aa  95.9  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0353  Na+/solute symporter  24.39 
 
 
479 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.606466  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3448  Na+/solute symporter  25.4 
 
 
495 aa  95.9  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 
492 aa  94.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  23.15 
 
 
484 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.16 
 
 
522 aa  94  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  23.15 
 
 
484 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  23.15 
 
 
484 aa  94  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0871  Na+/solute symporter  23.42 
 
 
482 aa  94  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.857902  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  24.84 
 
 
492 aa  94  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25.65 
 
 
492 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.65 
 
 
492 aa  93.6  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  24.01 
 
 
483 aa  93.6  8e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0800  Na+/solute symporter  23.42 
 
 
483 aa  93.6  8e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  24.27 
 
 
482 aa  93.6  8e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  23.61 
 
 
483 aa  93.2  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2927  Na+/solute symporter  26.17 
 
 
491 aa  93.6  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  26.03 
 
 
492 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0338  Na+/solute symporter  25.37 
 
 
479 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  25.24 
 
 
487 aa  93.2  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  23.67 
 
 
479 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 
493 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  25.29 
 
 
493 aa  92.4  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  25.29 
 
 
493 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0779  Na+/solute symporter  25.53 
 
 
482 aa  92  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  25.29 
 
 
492 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  26.11 
 
 
464 aa  92.4  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  24.24 
 
 
482 aa  92  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  24.34 
 
 
480 aa  92.4  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.54 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.54 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.9 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.54 
 
 
492 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0801  SSS sodium solute transporter superfamily  27.12 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25.34 
 
 
492 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.11 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  23.3 
 
 
483 aa  90.9  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  23.06 
 
 
524 aa  90.9  5e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.56 
 
 
492 aa  90.5  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  22.96 
 
 
483 aa  90.5  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  24.8 
 
 
488 aa  90.5  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3843  SSS sodium solute transporter superfamily  24.8 
 
 
541 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>